党的十八届三中全会开启了中国全面深化改革的序幕，当前各项改革已经进入关键时期，矛盾和问题日益凸显，困难和阻力与日俱增。地方行政审批制度改革是中国全面深化改革的重要组成部分，关系到群众切身利益。面对改革中遇到的困难和阻力，需要地方政府各部门充分协同与联动，形成整体性合力，共同推动改革走向深入。目前阻碍地方行政审批制度改革中各部门协同与联动的原因主要是官僚科层制带来的“碎片化”问题。诞生于上个世纪九十年代的整体性治理理论为解决“碎片化”问题提供了理论支撑。该理论以全球化为背景，以对传统公共管理范式的批判为基础，以信息网络技术的发展为保障，从协调与整合的角度，提出了解决“碎片化”问题的思路。本文从确立整体性治理理论分析框架入手，先是分析了在地方行政审批制度改革中加强部门协同与联动的必要性，而后以地方行政审批制度改革推进和深化的一个特例——浙江省L市J县“最多跑一次”改革为案例，分析了在这一改革前的地方行政审批制度改革中部门协同与联动存在的问题及成因，并对在“最多跑一次”改革中体现出来的部门协同与联动的具体做法、成效及经验启示进行了总结分析，在此基础上，进一步提出了加强地方行政审批制度改革中部门协同与联动机制的具体对策。
　　关于整体性治理理论的分析框架，本文主要从其理论内涵及其与地方行政审批制度改革中部门协同与联动的关联性来构建。关于J县“最多跑一次”改革前地方行政审批制度改革中部门协同与联动存在的问题，本文认为主要在于四个方面的“碎片化”，一是价值观念碎片化，二是部门职能碎片化，三是办事流程碎片化，四是数据信息碎片化。对于这些“碎片化”问题产生的原因，本文主要从理念、方法、制度、手段等四个方面进行分析。分别是理念上缺少服务意识、方法上缺少顶层设计、制度上缺少监督制约、手段上缺少权力整合。对“最多跑一次”改革这一成功案例的分析，本文着重从如何实现部门协同与联动、取得的成效以及经验启示来进行分析。本文认为这一改革部门协同与联动取得的成效主要在于提升了服务效能、收获了群众满意、优化了制度环境、密切了部门关系等四方面。之后，本文在前面研究的基础上，就如何建立地方行政审批制度改革中的部门协同与联动机制提出五个方面对策:一要强化整体价值观的引领;二要构建整体性的推进机制;三要建立整体性的协调机制;四要确立整体性的组织架构;五要寻求国家层面顶层设计。