目的：　　细菌性脑膜炎(bacterial meningitis，BM)是由各种细菌侵犯中枢神经系统所致的急性或慢性炎症性疾病，具有较高的发病率、病死率和致残率，近年来随着疫苗的使用及细菌耐药性的变化等，感染性疾病的疾病谱发生了一系列的变化，BM发病率呈逐渐上升趋势。临床传统检测方法多为外周血或脑脊液(cerebrospinal fluid，CSF)病原菌的分离、培养、鉴定，但操作强度大、检测时间长、阳性发现率低。分子诊断学方法可以提高脑脊液病原检出率，但目前临床应用较少。　　本研究的目的：①探讨宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing，mNGS)在成人BM诊断中的潜在应用价值;②考察mNGS技术相较于传统临床病原检测方法、脑脊液综合病原证据在BM病原学诊断上的优势。　　方法：　　①研究对象：本研究为回顾性病例分析研究，收集2017年3月至2019年3月在河南省人民医院神经内科住院治疗并高度疑诊为BM的20例患者的临床资料。详细记录每位患者的病史、体征、实验室及辅助检查结果。②诊断标准：临床存在脑膜炎/脑炎症状、体征，脑脊液常规细胞数≥500×106/L，有或无血及CSF病原证据。③研究方法：收集2～3ml CSF，离体30min内低温保存(-80℃)，取300μL CSF进行脱氧核糖核酸提取，提取后的核酸用超声破碎至200-300bp大小的基因片段，去除测序接头序列以及引物序列并过滤低质量值数据后，进行环化扩增复制(RCA)生成DNA纳米球(DNA Nano Ball，DNB)，将制备好的DNB加载到芯片上，使用BGISEQ-500进行测序，去除人参考基因组序列的宿主信息干扰后，剩下的数据与专用的微生物大数据库比对。　　数据分析：　　统计学分析采用SPSS22.0软件，计数资料采用“例数”和“率”表示。计算在各方法在BM诊断中的灵敏度和特异度。配对样本间诊断方法的比较采用McNemar检验;P＜0.05时为差异有统计学意义。　　结果：　　1.20例临床高度疑诊BM的患者中，2例患者血液中检出单核增生性李斯特菌、1例患者脑脊液培养出肺炎克雷伯杆菌、2例患者脑脊液脑脊液Xpert MTB/RIF检测到结核分枝杆菌复合群;20例BM患者均进行脑脊液mNGS检测，以脑脊液mNGS细菌界序列数＞1为条件，排除背景序列后，8例患者有阳性发现;　　2.以临床高度疑诊为金标准，即脑脊液细胞数≥500×106/L，脑脊液培养的敏感度为5％(1/20)，脑脊液综合病原证据的敏感度为15％(3/20)，传统临床病原检测方法的敏感度为25％(5/20)，mNGS敏感度为40％(8/20)。　　3.用McNemar检验对20例临床高度疑诊BM患者mNGS与临床总体病原学比较，两者差异无统计学意义(McNemar检验，P=0.375＞0.05)，尚不能认为两种实验结果的阳性率不同;　　4.用McNemar检验对20例临床高度疑诊BM患者的脑脊液mNGS结果与临床脑脊液病原学证据检测的结果比较，两者差异无统计学意义(McNemar检验，P=0.219＞0.05)，尚不能认为两种实验结果的阳性率不同。　　结论：　　CSF常规细胞数≥500×106/L时，考虑到样本量有限，目前尚不能认为mNGS方法的应用能够提高脑脊液病原检出率，需要进一步扩大样本量。