单链端粒DNA的溶液行为研究

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端粒是真核细胞染色体末端一些蛋白质与DNA的复合物,该种复合物的结构起到保护染色体以及调控细胞分裂周期的重要作用。在所有的脊椎动物中,端粒DNA是由~1000个TTAGGG序列跟其对应的互补序列构成双链DNA的结构组成,且在双链的末端还有~200个核苷酸序列长度的单链端粒DNA。本论文的研究对象就是单链端粒DNA,单链的富含鸟嘌呤(G)的端粒DNA序列在一定条件下可以形成连续的G-四链体结构。由于该结构在超分子化学,纳米器件的设计以及抗癌药物的研发等方面具有广泛的应用前景,所以引起了大家广泛的研究兴趣。本论文中,我们具体研究了以下内容:  首先我们用分析型超速离心(AUC)研究不同链长的端粒DNA在钠离子、钾离子、以及无钠钾盐中的变化,然后研究了不同浓度的d[AGGG(TTAGGG)6](G6-DNA)在钾离子条件下的变化,发现其在钾离子溶液中会存在单体和二聚体的平衡,其中分子内的G-四链体结构比分子间的二聚体结构更加稳定,并得到了该平衡的平衡常数;接着我们用分析型超速离心(AUC)、圆二色(CD)、聚丙烯酰胺凝胶电泳法(PAGE)等方法研究了短序列的单链端粒DNA-d(TTAGGG)(G01-DNA)对于G6-DNA的单体-二聚体平衡的影响。结果表明:G01-DNA会与G6-DNA未形成G-quadruplex的部分结合,进而影响G6-DNA的单体-二聚体的平衡。本项研究可以加深对于长链端粒DNA结构的理解。
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