目的:比较胆管癌组织与正常胆管组织的蛋白质组表达差异,寻找胆管癌相关的蛋白质,选择敏感的分子标志物。方法:1.根据实验要求采集合适的标本,液氮保存。对样品进行预处理,尽量减少样品中杂质对实验结果的影响。2.运用蛋白质组学技术,对16例胆管癌患者的胆管癌组织和正常胆管组织进行胶内差异双向凝胶电泳(2-DE),用PDQuest软件对凝胶图像进行分析,比较蛋白质点分布的差异情况。3.选择差异表达超过2倍的蛋白质点进行MALDI-TOF质谱分析,并且通过数据检索和生物信息学分析来鉴定出一些较有意义的差异蛋白质。结果:成功建立胆管癌组织和正常组织的双向凝胶电泳图谱,胆管癌组织和正常胆管组织平均蛋白质斑点数分别为1187和1148,其中表达差异超过2倍的斑点共有32个,质谱分析和数据库检索共鉴定出l8种蛋白质,包括Fibroblast growth factor recptor substrate 2 (FRS2)、catenin, beta 1、extracellular response kinase等。从功能上分析,这些差异蛋白质与癌细胞的发生、增殖、分化、转移等相关。结论:胆管癌组织与正常胆管组织间有l8种差异蛋白质可能为研究胆管癌的生物学行为提供新的分子标志物。