目的探讨肝细胞癌（hepatocellaler carcimona, HCC）患者外周血浆和肿瘤组织中FHIT、RASSF1A基因甲基化及其临床意义。方法应用甲基化特异性PCR(Methylation-speciafic PCR, MSP)检测36例HCC患者血浆及对应肿瘤组织、10例健康对照血浆中的FHIT、RASSF1A基因启动子甲基化状态，并分析其与临床参数的关系。结果36例HCC患者癌组织和外周血浆中FHIT基因甲基化率分别为75%（27/36）和52.8%（19/36），二者相关系数为r=0.482（P=0.003）；癌组织和血浆中RASSF1A基因甲基化率分别为83.3%（30/36）和61.1%（22/36），二者相关系数为r=0.561（P=0.0004）。10例健康对照血浆中均未检出甲基化改变。HCC患者外周血浆和癌组织中FHIT、RASSF1A基因的甲基化率与患者年龄、性别、AFP、有无肝炎病毒感染（HBV、HCV）、有无肝硬化、Child分级、肿瘤个数、包膜完整与否、有无癌栓、是否复发、病理分级、肿瘤分期无统计学相关性。以AFP≥400ug/L为阳性，本组病例AFP阳性率为44.4%；以AFP≥20ug/L为阳性，本组病例阳性率为69.4%。在全部患者中，血浆FHIT和RASSF1A基因甲基化联合检出率为72.2％。在AFP﹤400ug/L的患者血浆中，两基因甲基化联合检出率为80%（16/20）；在AFP﹤20ug/L的患者血浆中，两基因甲基化联合检出率为54.5%（6/11）。结论HCC患者血浆和肿瘤组织中两基因甲基化状态有良好的一致性。癌组织和血浆中基因甲基化改变与各临床参数无相关性。血浆基因甲基化联合检测诊断HCC阳性率优于AFP。