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目的:国外已有一些研究报道关于PNPLA3 rs738409 SNP与HCC的相关性,但是目前国内尚缺乏PNPLA3 rs738409 SNP与HCC相关性的大样本病例对照研究,因此我们分析东北地区人群中HCC患者的PNPLA3 rs738409 SNP,研究东北地区汉族人群PNPLA3 rs738409 SNP与HCC发病的相关性。并探讨PNPLA3 rs738409 SNP是否是HCC发病的高危因素。方法:采用病例对照的研究方法,以东北地区汉族人群为研究对象,纳入217例HCC患者作为病例组,其中乙型病毒性肝炎后肝癌患者109例,丙型病毒性肝炎后肝癌患者70例,酒精性肝病后肝癌患者38例,164例正常人群作为健康对照组。病例组分为乙型病毒性肝炎后肝癌组、丙型病毒性肝炎后肝癌组及酒精性肝病后肝癌组。采用RT-PCR方法检测PNPLA3 rs738409位点的SNP。结果:(1)基本情况:在性别及年龄分布上,健康对照组与病例组相比,差异无统计学意义(P分别为0.895及0.344),具有可比性。病例组中白蛋白明显低于健康对照组,而肝脏酶学指标、TBIL及AFP均明显高于健康对照组。除AFP外,各组间白蛋白、肝脏酶学指标、TBIL差异均无统计学意义(P>0.05)。(2)Hardy–Weinberg遗传平衡检验:健康对照组及病例组rs738409位点等位基因频率符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律(健康对照组PNPLA3 rs738409 C>G:P=0.928,病例组PNPLA3 rs738409 C>G:P=0.088),样本具有群体代表性。(3)PNPLA3 rs738409在各组间及组内的基因分布情况:根据探针上荧光标记的不同,将PNPLA3 rs738409基因分为GG、CG、CC三种基因型,健康对照组中CC、CG、GG基因型频率及G等位基因型频率分别为0.482、0.427、0.091、0.305,病例组中CC、CG、GG基因型频率及G等位基因型频率分别为0.373、0.429、0.198、0.412,PNPLA3基因rs738409位点基因型在病例组和健康对照组中的分布差异有统计学意义(P=0.004),且与健康对照组相比,病例组中PNPLA3 rs738409 G等位基因型频率明显升高(OR=9.313,P=0.002)。乙肝肝硬化组中,CC、CG、GG基因型频率及G等位基因型频率分别为0.367、0.431、0.202、0.417,健康对照组与乙肝肝硬化组基因型及等位基因分布差异有统计学意义(P分别为0.007及0.009);丙肝肝硬化组中CC、CG、GG基因型频率及G等位基因型频率分别为0.457,0.386,0.157、0.350,健康对照组与丙肝肝硬化组基因型及等位基因分布差异无统计学意义(P分别为0.337及0.143);酒精性肝硬化组中CC、CG、GG基因型频率及G等位基因型频率分别为0.237,0.500,0.263、0.513,健康对照组与酒精性肝硬化组基因型及等位基因分布差异有统计学意义(P分别为0.001及0.009)。(4)PNPLA3 rs738409与各组生化指标的关系:将病例组按照是否携带PNPLA3rs738409 G等位基因分成CC/CG组与GG组,在乙肝组、丙肝组及酒精组中,CC/CG组与GG组年龄、性别、肝脏酶学指标及TBIL差异均无统计学意义。(5)PNPLA3 rs738409与肝硬化分级的关系:将病例组伴有肝硬化的患者根据Child-Pugh评分将其分为≥7分组与<7分组,Child-Pugh评分≥7分组患者PNPLA3rs738409 GG基因型比例明显高于<7分组,其差异具有统计学意义(P=0.046)。结论:PNPLA3 rs738409 SNP在东北地区汉族人群中与乙型病毒性肝炎后肝癌、酒精性肝病后肝癌的发生具有相关性。