【摘 要】
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狍(Capreolus spp.)是偶蹄目动物中唯一的胚胎滞育物种。根据化石记录,它们最早出现在大约3.3-2.4百万年前的俄罗斯东部乌东加。狍属包含两个现生物种:栖息于欧洲大部分地区的欧洲狍(C.Capreolus)和分布在亚洲古北界和东欧部分地区的西伯利亚狍(C.pygargus)。在中国,狍在早更新世就已经存在,在多个化石点留下大量化石用于详细的形态分析,但狍属化石的分类学地位、古代与现代狍
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狍(Capreolus spp.)是偶蹄目动物中唯一的胚胎滞育物种。根据化石记录,它们最早出现在大约3.3-2.4百万年前的俄罗斯东部乌东加。狍属包含两个现生物种:栖息于欧洲大部分地区的欧洲狍(C.Capreolus)和分布在亚洲古北界和东欧部分地区的西伯利亚狍(C.pygargus)。在中国,狍在早更新世就已经存在,在多个化石点留下大量化石用于详细的形态分析,但狍属化石的分类学地位、古代与现代狍种群的遗传联系等问题均有待进一步探索。目前,对中国狍的所有分子研究都集中在现代标本上,还未基于古DNA对中国狍展开过遗传学研究。本研究通过古DNA提取、测序文库构建和新一代测序,获得了中国东北地区4件狍遗骸的接近完整的线粒体基因组及部分核基因组分子数据。基于研究样品及数据库中已有同源基因组数据进行种群遗传学分析,探讨了古代狍与现生种群的遗传联系,并研究了该物种的种群动态变化和演化历史。基于狍属基因组数据的系统发育分析显示,4个东北古代狍样品均落在西伯利亚狍分支,在物种归属上被分子鉴定为西伯利亚狍。基于西伯利亚狍部分线粒体序列的系统地理分析显示,贝加尔湖两侧的西伯利亚狍种群具有不同的单倍群组成,这一结果为基于形态学特征提出的西伯利亚狍亚种划分提供了分子证据,支持将中国古代东北狍划分为西伯利亚狍天山亚种。分歧时间计算结果显示,西伯利亚狍和欧洲狍在约2.25百万年前产生分歧,西伯利亚狍支系的最近共同祖先生活在约34万年前。种群动态历史分析显示,西伯利亚狍的母系有效种群数量大约在32.5万年前开始逐渐上升,并在大约22.5万年前达到顶峰,在随后的17.5万年间保持稳定,而后在约5-1.8万年间减少一半,最后保持平稳直至现在。主成分分析显示,在第一个主成分(PC1=80.3%)上,西伯利亚狍聚集在左侧,而欧洲狍聚集在右侧,显示出西伯利亚狍和欧洲狍之间明显的基因组差异。本研究为追溯狍的种群历史提供了实时的分子记录,确定了东北地区狍属化石的分类学地位、估算了狍属各母系遗传支系的分歧时间、分析了西伯利亚狍分子谱系地理格局、重建了狍属在过去30多万年来的母系种群动态历史,为研究狍的演化史和种群动态提供了新的视角。
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