近年来,随着国家对于高等教育的建设举措,各大高校扩大招生数量,由此也引发了高校的财务资金问题。发生在我国高校的财务舞弊案件逐年增多,并且舞弊案件的严重性也有更加严重化的趋势。然而高校作为培养高等教育人才的基地,良好的教育教学之风对于学生成长成才起着重要作用,因此一次又一次高校财务舞弊案件的曝光,也引起了社会对于高校自我内部控制的高度关注。提高高校内部控制系统的全面性、完整性和有效性对于提高高校的风险防范能力有极为重要的意义。做好风险的测评与防范工作,内部控制是最为重要和有效的手段。从目前的制度体系来看,我国高校事业单位的内部控制并没有形成健全的体系,而由于事业单位的不以提升收入为主要目的,使得事业单位内部控制系统与企业内部控制系统有着较大差异,仍需要我们在实践中探索。本文以N高校为研究对象,按照内部控制系统的五要素出发,深入分析N高校在内部控制过程中所出现的问题与欠缺之处,发现可能造成财务舞弊案件的风险点。在对问题进行分析之后发现,五要素中存在的问题有交叉之处,同一个内部控制缺陷可能会同时影响两个甚至多个要素的健全,因此本文对发现的问题,按照单位层面、业务层面和评价与监督体系三个方面,进行了归纳与总结,并从这三个层面对N高校的内部控制体系建设做出了优化与改进。