蒙古国西北部和我国新疆北部狼遗传多样性研究

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以mtDNA D-loop区序列为遗传标记,对来自蒙古国西北部和我国新疆北部5个狼地理种群进行遗传多样性研究,为狼的亚种分类提供基础的分子遗传信息。主要研究结果如下:1.蒙古国西北部和我国新疆北部狼地理种群的线粒体DNA控制区核苷酸变异蒙古国西北部和我国新疆北部狼地理种群的mtDNA D-loop区序列长度在532-540bp之间。共发现36个变异位点,占全部序列分析位点的6.766%。其中,简约信息位点15个,占全部多态变异位点的41.66%。单一多态位点14个,占全部多态变异位点的38.89%。mtDNA D-loop区T碱基含量最高(30.0%),其次是C碱基(27.1%),A碱基居第三位(26.3%),G碱基含量最低,仅为16.6%。A+T总量(56.3%)显明高于(G+C)的总量(43.7%)。多态位点中转换出现11次,颠换仅出现1次。2.蒙古国西北部和我国新疆北部狼的遗传多样性蒙古国西北部和我国新疆北部狼地理种群共发现15个单倍型,其中蒙古国西北部种群为8个,青河种群3个,阿尔泰山种群有4个,萨吾尔山种群2个,卡拉麦里山种群2个。5个地理种群间仅单倍型4、5、6为共享单倍型,其余各单倍型均为各种群所独享。平均单倍型多样性:0.865±0.035;平均核苷酸多样性:0.01056±0.00419。3.蒙古国西北部和我国新疆北部狼地理种群间的遗传距离以Kimum 2-parameter model为统计模型分析种群间遗传距离,发现蒙古国西北部和我国新疆北部狼各种群间的遗传距离位于0.00385-0.02013之间。卡拉麦里山种群与萨吾尔山种群的遗传距离最近,为0.00385。蒙古国西北部种群和萨吾尔山种群的遗传距离最远,为0.02013。蒙古国西北部和我国新疆北部5个狼地理种群的种内平均遗传距离为0.01092。4.蒙古国西北部和我国新疆北部狼种群间的遗传分化和基因流使用DnaSP5.10软件探究蒙古国西北部和我国新疆北部狼地域种群间的遗传分化(Fst)与基因流(Nm)。Fst值在0.08063-0.78592范围之间。蒙古国西北部种群与卡拉麦里山种群的Fst值最大,为0.78592。阿尔泰山种群与青河种群间的Fst值最小,为0.08063。Nm值在0.06809-2.85058之间。蒙古国西北部种群和卡拉麦里山种群的Nm值最小,为0.06809。青河种群与阿尔泰山种群的Nm值最大,为2.85058。5.蒙古国西北部和我国新疆北部狼种群间的单倍型系统发育关系通过Mega5.10和Network4.1.1.2软件构建了蒙古国西北部和我国新疆北部狼15个单倍型的分子系统进化树以及网络图。15个单倍型分为支系A(Clade A)和支系B(Clade B)。Clade A由9个单倍型组成,占所有单倍型总数的60%。其中蒙古国西北部种群有2个单倍型(Hap6、Hap13),剩余7个单倍型均为我国新疆北部群体单倍型。Clade B共6个单倍型,占所有单倍型总数的40%,构成CladeB的单倍型全部来自蒙古国西北部种群,其他地区的单倍型则全部属于CladeA。6.蒙古国西北部和我国新疆北部狼的种群历史通过DnaSP5.10软件,对蒙古国西北部和我国新疆北部5个狼种群分别进行Tajima’s D和Fu’s Fs中性检验,探究蒙古国西北部和我国新疆北部狼的种群历史。蒙古国西北部种群的Tajima’s D值为-0.52073,我国新疆北部群体作为一个整体研究,发现新疆北部群体的Tajima’s D值为-1.85349。蒙古国西北部和我国新疆北部5个狼种群的Fu’s Fs值在-1.530至1.237之间,除卡拉麦里山种群为负值外,其余都是正值。表明我国新疆北部群体有一个较强的种群扩散和增长历史,而蒙古国西北部种群没有经历过群体扩张,种群大小保持稳定。7.蒙古国西北部和我国新疆北部5个种群狼的分歧时间利用分歧时间计算公式T=D/2r和校正后的哺乳动物mtDNA D-loop区的平均核苷酸替代率,计算各地理种群进化分歧时间。分析得出,蒙古国西北部种群与新疆北部四个种群分歧时间远大于萨吾尔山、卡拉麦里山、青河、阿尔泰山种群。
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