2009年我国启动了9项基本公共卫生服务，并把促进基本公共卫生服务逐步均等化作为医药卫生体制改革的五项重点工作之一。而根据2008年“WHO基本医疗卫生制度实施策略研究”项目报告中的主要结论，总结发现导致重庆市基本公共卫生服务提供及运行机制不完善的财政方面的原因主要有：一、由于地方政策不明确和各级财政保障机制不到位，基层公共卫生服务尤其是农村基层公共卫生服务人、财、物等供给严重不足，地方财政无法满足当地居民基本公共卫生服务需求；二、由于各级公共财政投入前未开展科学有效的民生需求调查，导致某些公共财政投入未能保障民生基本公共卫生服务需求重点，某些公共卫生专款经费中用于行政运转的支出远高于发展性和民生性支出，导致公共财政经费使用不合理且使用效率低；三、由于公共财政资金的监管力度不够，使用结果也往往缺乏绩效评估，造成有些机构应向城乡居民免费提供的基本公共卫生服务尚未有效开展；四、由于无科学的考评机制和补偿激励机制，基层保健人员公共卫生服务工作积极性较低，服务效果差；五、由于缺乏分事权、分项目、按比例分担的财政投入保障模式，各级基本公共卫生服务提供机构难以明确服务范围和支出责任。因此，对重庆市基本公共卫生服务财政分担补偿机制展开研究，是十分必要且有意义的。本文首先对我国目前的卫生投入和公共卫生投入规模和各级财政分担进行了分析，并与国际其他国家进行了比较，发现我国卫生投入和公共卫生投入水平远远低于世界大多数国家，且在各级财政分担中，中央投入比例相对较低，地方财政压力较大。在对全国投入分析的基础上，对重庆市进行了抽样调查，并对重庆市卫生总投入、公共卫生投入和基本公共卫生服务投入情况、各级财政投入情况和补偿情况进行了研究分析，发现重庆市在基本公共卫生服务财政分担补偿方面还存在以下问题：一是人均筹资标准低，投入总量不足；二是财政体制和转移支付制度不完善；三是地区投入差异大，地区间不均等现象突出；四是农村供需矛盾突出，城乡差距大；五是基本公共卫生服务绩效考核体系不完善。针对问题提出以下建议：一是进一步完善财政体制和转移支付制度，充分发挥财政政策对基本公共卫生服务均等化的推动作用；二是强化各级政府基本公共卫生投入责任，健全基本公共卫生服务经费保障机制；三是进一步完善基本公共卫生服务体系，增强基本公共卫生服务提供能力；四是强化绩效考核，确保基本公共卫生服务的财政投入成效