大豆是我国主要的油料和经济作物,已有五千多年的种植历史。栽培大豆通常被认为是由野生大豆驯化而来的,而菜用大豆就是栽培大豆中的一种特殊类型。虽然大豆起源于我国,但专用型菜用大豆的发展较晚,早期育种主要以从台湾或者日本引进优异品种进行筛选或杂交选育为主。与普通大豆相比,相对较短的育种历史和较窄的育种资源遗传基础成为限制菜用大豆育种的主要因素。而目前主要用于评价大豆种质遗传多样性的简单重复序列（Simple Sequence Repeat,SSR）标记,也存在数量相对较少、分析操作复杂、标记大小不易确定而无法跨研究使用等不利因素。因而,开发密度更高、分析更简便、基因型确定可以跨研究使用的新型分子标记,并使用这些标记对菜用大豆品种（系）进行遗传多样性分析以及其他各类研究,具有非常重要的应用价值。本文根据Soy Base数据库上最新的基因组序列信息（Glyma.Wm82.a2,Gmax2.0）,开发平均分布于大豆20条染色体上基于高分辨率熔解曲线（High-resolution Melting,HRM）技术的单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism,SNP）标记,并将开发的标记用于主推菜用大豆品种“浙鲜九号”的DNA指纹图谱构建以及用于31份菜用大豆种质的SNP分型和遗传多样性分析。完成的主要研究工作和成果总结如下:1)一共开发了平均分布于大豆20条染色体上、用于HRM分析的101个SNP位点,并将其成功转化为SNP标记。其中,Gm01和Gm18上各6个SNP标记,Gm11上4个,其他染色体上各5个。2)以大豆品种“Williams 82”为参考,利用开发的标记对主推菜用大豆品种“浙鲜九号”进行基于HRM技术的SNP分型。并随机对9个SNP标记的PCR产物进行测序以验证HRM分析的准确性。在所有这些测序的SNP位点上观察到分型结果和Sanger测序之间的一致性,因此所建立的基于HRM的SNP分析系统是准确的并且可用于大豆SNP基因分型。这些标记中有34个（33.7%）SNP位点在“浙鲜九号”和“Williams 82”之间表现为多态性。因此,“浙鲜九号”的SNP指纹图谱为,“TCAACT AGCCA CTGCT CCTAG ATGAC CGCGA TGGGG TGGGC CACCA TCACT TCTT CTGGT TACCA TACCG TGGCG AGGTC TAAAC GATCTC CTCTG CTACT”。3)以大豆品种“Williams 82”为参照,利用开发的标记对31份菜用大豆种质进行SNP分型和遗传多样性分析。61.4%（62/101）的标记在种质间表现出多态性。进一步分析表明,32份大豆品种（系）的遗传相似性系数在0.634-1.000,平均为0.855;“Williams 82”与其他品种（系）遗传距离最远。在相似系数为0.822处,可将32份大豆品种（系）分为5个类群;其中第V类群最大,含有26份菜用大豆种质。在相似系数0.882处,可将第V类群划分为6个亚群。