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【目的】
1.检测p16,eIF<,4>E,cIAP1,Dab2,FHIT,cFLIP等基因在宫颈癌中有否扩增或丢失,找出与宫颈癌发生发展相关的分子标志。
2.检测CDK4在宫颈癌发生发展中的蛋白表达情况,探讨CDK4在宫颈癌发生发展过程中的意义及作用。
3.探讨多重连接探针扩增法(MLPA,Multiplex ligation dependent probeamplification),以期在本实验室建立起这一新技术。
注:本实验中所用宫颈癌标本均为宫颈鳞癌,在文中均简称宫颈癌。
【方法】
1.显微切割及DNA提取
从新鲜宫颈癌标本(2004年10月开始收集,于-80℃冰箱保存)和2004年的宫颈癌石蜡标本中,筛选出15例进行显微切割和DNA提取。
新鲜标本做冰冻切片,石蜡标本切片并脱蜡,均用苏木素轻染色,在倒置显微镜下找准正常组织(间质)和癌组织的部位,进行显微切割,分别取正常组织和癌细胞群,用商用试剂盒提取DNA。
2.PCR 扩增靶基因
检测的6个靶基因是p16(MTS1,多肿瘤抑制基因1)、eIF4E(真核细胞翻译起始因子4E)、cIAP1(一种凋亡抑制因子)、Dab2(分裂原反应性磷酸化蛋白基因)、FHIT(脆性组氨酸三联基因)、cFLIP(细胞型Fas相关死亡区域蛋白样β白介素-1 转换酶抑制蛋白基因,是一种凋亡抑制因子)。以各靶基因或靶基因的一个外显子为模板设计引物,进行PCR扩增检测。
3.扫描分析,确定基因扩增或丢失
运用bandscan 4.3对PCR扩增产物的电泳条带进行灰度扫描,并用软件SPSS 13.0对数据进行处理,确定发生扩增或丢失的基因或外显子。
4.免疫组化检测CDK4的表达
运用免疫组化SP法检测宫颈病变中CDK4的表达情况。检测对象为2004年全年的宫颈石蜡标本,包括19例慢性宫颈炎,15例低级别鳞状上皮内变(LSIL,包括 CIN Ⅰ),41 例高级别鳞状上皮内病变(HSIL,包括CINⅡ,CINⅢ),66例宫颈癌(squamous carcinoma of the cervix,SCC)。
5.MLPA方法学的建立
根据p16第2个外显子序列设计两条探针,每条探针包括两段序列。一段与母板 DNA p16 第二外显子序列互补,两探针中的这一段可前后相邻(没有碱基空隙)地结合到模板上;另一段根据M13噬菌体序列所设计,不能结合到模板DNA上,仅作为PCR通用引物的结合依据。在实验中,先使两条探针与正常组织(血样)DNA结合后,用DNA连接酶(T4 DNALigase,Ampligase Thermostale DNA Ligase,Taq DNA 连接酶)在合适条件下将两探针连接,连接成线的探针数量代表p16基因拷贝数量;之后用连接产物做PCR反应模板,进行PCR扩增和检测。
【结果】
1.癌组织的基因拷贝异常
在宫颈癌中,p16 exon1、eIF4E、cIAP1、Dab2均有不同程度的扩增,癌组织和正常组织中p16 exon1的拷贝数有差别,该基因在癌组织中的拷贝数较正常组织中的拷贝数明显增加,二者相比差异有统计学意义(P<0.05)。eIF4E,clAP1 和 Dab2 在宫颈癌中的基因拷贝异常情况均与p16 exon1相同(P<0.05)。FHIT exon10和cFLIP则无明显缺失或扩增(P>0.05)。
2.CDK4 在宫颈癌及其前期病变中的表达升高
按照慢性宫颈炎、LSIL、HSIL、宫颈癌的顺序,CDK4 的阳性表达率分别是21.1%(4/19例)、46.7%(7/15例)、73.2%(30/41例)、92.4%(61/66例)。各组CDK4阳性表达率与宫颈癌组CDK4阳性表达率的差异均具有极显著性意义(P<0.01)。宫颈炎组与LSIL组、LSIL组与HSIL组相比较差异均没有统计学意义(P>0.05)。因宫颈炎与LSIL绝大多数都可治愈,病变严重程度相似,故可将宫颈炎组与LSIL组合为一组,与HSIL组进行双侧X<'2>检验,结果显示CDK4 的阳性表达率的差异亦具有极显著性意义(P<0.01)。
3.MLPA 实验
以人的DNA做母板的情况下,T4 DNA Ligase 可将两条探针连接起来,用Ampligase Thermostale DNA Ligase和Taq DNA 连接酶则不能将其连接。但在不用人的DNA做母板的情况下(用鱼精DNA),或不加母板的情况下(用水来补足连接体系),用T4 DNA Ligase 仍可将这两条探针连接起来。
【结论】
1.p16 exon1在宫颈癌中的基因改变为扩增,这可以从另外一个角度解释在宫颈癌中p16蛋白表达增加的机制。本实验的结果从基因结构的改变方面表明了p16可能可以作为宫颈癌发生发展的有用的分子标志。
2.eIF4E、cIAP1、Dab2在宫颈癌中表现为扩增,可以初步考虑把这3个基因作为宫颈癌发生发展过程中的分子标志。
3.FHIT exon10、cFLIP在宫颈癌中无明显异常变化,提示FHIT exon10与cFLIP 基因可能与宫颈癌的发生发展关系不大。
4.CDK4蛋白在宫颈癌及宫颈癌前病变细胞中过表达,且CDK4的表达有随宫颈癌的发生发展而逐渐增高的趋势,说明CDK4可能促进宫颈癌的发生发展,并提示CDK4可能是宫颈癌发生发展过程中的一个较好的辅助诊断标记。
5.在MLPA实验中,用T4 DNA Ligase 可将两条探针连接起来。但母板存在与否,T4 DNA Ligase都可使两条探针连接,表明 T4 DNA Ligase 可使两条探针自连,实验暂不成功。