肝细胞癌干性分型及其预后特征研究

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肝细胞癌是全球范围内的一种具有高侵袭性的癌症,它严重的危害着人类的健康,而具有自我更新和治疗抗性的肿瘤干细胞通过促进肝癌细胞的侵袭和转移,在肝细胞癌的发生发展中扮演重要的角色。基于mRNA测定的干细胞指数mRNAsi(stemness index based on mRNA expression)是衡量肿瘤细胞与干细胞之间相似性的指标,可以被用来量化肿瘤干细胞,可称为肿瘤干性指数。然而基于mRNAsi来对肝细胞癌的研究鲜有人关注。因此,在本文章中,我们使用了来自癌症基因组图谱(TCGA)的肝细胞癌相关数据和肝细胞癌的mRNAsi指数做了相关研究,研究结果如下:1、mRNAsi在癌组织中显著上调,并且利用mRNAsi相关基因,可以将肝细胞癌患者分为三种肿瘤干细胞亚型(Cancer Stem Cell Phenotype,CSCP),并根据mRNAsi的指数将病人三种亚型命名为CSCP-H,CSCP-L和CSCP-M。2、根据三种亚型与临床的关系,发现CSCP-H与较低的生存率和较短的无复发生存期显著相关。3、功能富集分析表明,核糖体,剪接体和核苷酸代谢相关通路在CSCP-H组患者中更加活跃,这些通路的异常激活可能导致了CSCP-H患者的低生存。4、较于CSCP-L和CSCP-M,CSCP-H在体细胞突变,肿瘤免疫细胞浸润,N6-甲基腺苷和DNA甲基化数据四个方面存在独特的基因组模式,CSCP-H具有更高的突变,免疫细胞浸润,这可能使得CSCP-H亚型病人更适合免疫疗法,此外,CSCPH患者有着异常的DNA甲基化和m6A基因的异常表达。5、本研究利用mRNAsi相关基因构建了与CSCP相关的预后模型,模型中的相关的基因可以将患者显著分为低危和高危人群,且有良好的预后特征,有望成为HCC患者的潜在治疗靶点。
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