[目的]了解云南省新发鼠疫疫情所分离鼠疫菌的表型及基因型特征、并对其进行溯源分析,藉此查明新发鼠疫疫情的性质及来源,为制定针对该疫源地科学地防控策略提供科学依据。[方法]1.表型测定:进行阿拉伯糖、密二糖、鼠李糖、麦芽糖及甘油的发酵实验,脱氮实验,VW毒力因子检测,色素沉着因子检测及营养需求来测定鹤庆鼠疫菌的表型特征。2.基因型测定:通过差异区段(Different region,DFR)分型、规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPRs)分型与可变数目串联重复序列(MLVA)分型(12+14策略)方法来判定新分离鼠疫菌的基因型别,同时以云南既往代表菌株信息为参照,利用BN6.6软件进行溯源分析。[结果]1.丽江菌株、剑川菌株与鹤庆菌株生化特性,均发酵阿拉伯糖、麦芽糖、甘油且脱氮阳性,生物型属于古典变种型;其他表型均为VW~+菌株、色素沉着因子阳性,营养需求类型为苯丙氨酸依赖、谷氨酸不依赖型。2.2017年云南省新分离15株鼠疫菌DFR型别一致均为DFR 01、02、13、23四个位点上缺失,其余位点不缺失,与丽江菌株有相同的DFR型别,为Genomovar05型。3.2017年云南省新分离15株鼠疫菌CRISPR分型中,YPa排序为“a1-a2-a3-a4-a5-a6-a7”,YPb为“b1-b2-b3-b4”,YPc为“c1-c2-c3”,与丽江菌株有着相同的型别为基因簇Ca7。4.鹤庆菌株位于丽江野鼠鼠疫簇内,为同一种MLVA基因型,与HQ1只在位点M22有差异,与位于整个丽江野鼠鼠疫簇的核心位置的丽江菌株2006-7号同源。[结论]鹤庆菌株、玉龙菌株与剑川菌株属于同一种生物型,均为古典变种型鼠疫耶尔森菌,毒力因子与营养需求等表型均一致。2017年云南省新分离15株鼠疫菌鼠疫菌株在CRISPRs分型与DFR分型上与丽江野鼠疫源地菌株一致,而MLVA(14+12)溯源分析表明,鹤庆菌株来源于丽江菌株的进一步分化,是丽江疫源地进一步向南扩散的结果,鉴于此种类型鼠疫菌的高致病性,应加强对该疫源地持续监测,并做好鼠间疫情的处置,降低其传播到人的风险。