从2003年我国第一次提出建立“预算绩效评价体系”起,各级政府对于公共财政支出的绩效水平越来越重视,特别是公共财政支农项目受到社会各界的广泛关注。中央连续11年颁布1号文件,部署落实“三农”工作,不断加大支农资金的投入力度。可是各类支农项目由于存在明显的行业特征,面临投入周期长、效益量化困难等特点,如何对其进行科学准确的绩效评价成了各级地方政府急需解决的问题。目前,我国财政支出绩效评价工作还处于刚刚起步阶段,仅有综合性的绩效评价指标体系出台,缺乏针对特定行业和领域的财政支出绩效评价体系,各级地方政府在进行绩效评价时还存在指标设置主观性强、可操作性差、指标测量缺乏科学性等问题,严重影响了财政支出项目绩效评价的准确性。针对这种情况,本文通过理论研究和实证分析相结合的方式,对国内外财政支出绩效评价的理论和方法进行了回顾,并在借鉴平衡计分卡和PART工具等理论成果的基础上,从本地区社会经济发展实际情况出发,紧密结合财政支农项目绩效目标的实现,优化和完善财政支农项目绩效评价指标体系。本文首先对财政支出绩效评价结构进行了分析,在综合运用平衡计分卡和PART工具的基础上构建绩效评价模型,确定项目制定、项目实施和项目效果三个绩效维度,并结合“4E”理论在已有的财政支出项目绩效评价体系的基础上提出了二级基本指标和三级具体指标。并通过隶属度分析和层次分析法对财政支农项目绩效评价指标进行筛选和权重的确定。然后,运用该评价指标体系对上海市闵行区财政支农项目进行实证分析,并运用鉴别力法和相关性分析对指标体系进行进一步的优化,进而形成了比较适合本地区本行业特点,具有一定实用价值的财政支农绩效评价指标体系,为今后加快财政预算改革,提高财政支农项目绩效水平提供依据。