为研究三峡消落带不同土地利用方式对土壤微生物群落多样性的影响,以三峡库区典型乡村消落带—忠县汝溪河流域消落带和城市消落带—重庆江北嘴大剧院消落带为研究区域,分别于2015年6月和2016年6月原位采集0~20 cm、20~40 cm、40~60 cm土壤,利用末端限制性片段长度多态性(terminal restriction fragment length polymorphism,T-RFLP)方法,探究三峡消落带不同土地利用方式下土壤不同土层的微生物群落多样性差异。研究发现:(1)在三峡消落带中,土地利用方式和土层不同程度的影响土壤理化性质。总体来看,乡村消落带中林地的水土保持能力优于草地,且乡村消落带林地和草地土壤氮和钾元素含量呈现高于城市消落带对相应林地和草地的趋势。这主要是由于土地利用方式和人为干扰对土壤的影响。(2)研究发现,土地利用方式、土层和采样时间显著影响细菌群落多样性。在乡村消落带中,林地和耕地土壤细菌群落显著高于草地,其中全氮、速效钾和速效磷含量显著影响细菌群落多样;城市消落带草地土壤细菌群落多样性呈高于林地的趋势,其中土壤水分和土壤养分显著影响细菌群落多样性。(3)研究发现,土地利用方式、土层和采样时间显著影响三峡消落带土壤真菌群落多样性,其中真菌群落多样性随土壤深度增加而较少。在水淹后,真菌群落多样性呈下降趋势。在乡村消落带中,林地和草地土壤真菌群落多样性高于耕地;分析发现土壤氮磷的含量显著影响真菌群落多样性。在城市消落带草地和林地真菌多样性无显著差异;分析发现土壤容重、总空隙度和钾磷的含量显著影响真菌群落多样性。建议消落带区停止耕作,减少人为干扰,进行植被生态恢复。(4)研究发现,土地利用方式和采样时间显著影响土壤放线菌多样性,但放线菌多样性在土层间无显著差异。在乡村消落带中,土壤放线菌多样性呈现草地≥林地≥耕地的趋势,分析表明pH值、有机质、土壤磷的含量显著影响放线菌多样性。在城市消落带的林地放线菌群落多样性大于或等于草地,分析表明土壤密度、总孔隙度、pH值、有机质、速效氮、钾磷元素含量显著影响放线菌群落。结论:为了保护三峡消落带的生态环境,提高其生态服务功能,建议限制耕作,减少人为干扰,加强生态恢复建设。