株高是大豆重要的农艺性状,直接影响着大豆的产量、品质与栽培模式。Copper等提出的以矮秆或半矮秆品种配套窄行密植栽培模式为核心的大豆高产技术体系,大幅度提高了当时美国的大豆产量。我国育种家也曾选育多个半矮秆品种,并实现创高产。但由于传统育种存在周期长、效率低等问题,限制了矮秆品种的选育与利用。创制优异矮秆种质,挖掘矮秆功能基因,并应用于分子育种,是解决这一问题的有效途径。本研究前期以大豆品系中国扁茎和美国扁茎为亲本,杂交后自交,获得了遗传稳定的矮秆株系,命名为F02。将F02与中国扁茎回交构建了BC1F2分离群体。遗传分析表明,在分离群体中,高株和矮株的株数比例符合3:1的孟德尔分离规律,说明矮秆性状受隐性单基因或遗传距离较近的少数基因控制。利用混合群体分离分析(BSA)的性状定位方法,将矮秆基因定位于19号染色体300,735bp-399,985bp和44,947,812bp-49,497,950bp两个区段内,第一个区段长度为99.25kb,第二个区段长度为4.55 Mb,其间共包含非同义突变SNP位点299个,非同义突变基因141个。利用SSR标记及新开发的dCAPS标记,将矮秆基因进一步精细定位于44,975,289bp-46,765,417bp区间内,总长度为1.79 Mb,包含49个非同义突变基因。为进一步确定候选基因,以亲本株高始有差异V7期为材料,对49个候选基因进行表达量分析,结果表明,20个基因的表达量在两亲本间存在显著性差异,其中Glyma.19G192400、Glyma.19G193900、Glyma.19G195800、Glyma.19G200900、Glyma.19G203800、Glyma.19G203900、Glyma.19G205400、Glyma.19G206100等8个基因在植物生长发育方面具有调节作用,通过对8个候选基因进行生物信息学分析,发现Glyma.19G206100与生长素响应因子同源性较高,因此将此基因列为重点候选基因。