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目的：肺癌是导致癌症相关死亡原因最主要的疾病,总的五年存活率约16％。在肺癌的研究中，肿瘤干细胞理论认为肺癌组织中存在肺癌干细胞，而且肺癌的起源、转移等生物学行为与干细胞标志物关系密切。因此，本实验通过免疫组化检测两个肿瘤干细胞标志物Nanog和Musashi1蛋白在50例早期非小细胞肺癌、50例癌旁正常肺组织和50例良性病变肺组织中的表达情况，并探讨这两个肿瘤干细胞标志物对肺癌发生、进展和迁徙等分子生物学方面的关系，为非小细胞肺癌的早期发现、诊疗和评估预后提供一定的理论和实验依据。 方法：采用免疫组化检测早期非小细胞肺癌组织（50例）、癌旁正常肺组织（50例）和良性病变组织（50例）中干细胞标志物Nanog和Musashi1两种蛋白的表达情况，并分析其临床意义。 结果：Nanog和Musashi1蛋白显著表达于早期非小细胞肺癌。1.Nanog蛋白在肺癌组、癌旁组和良性病变组中的阳性率分别为78%、0%和4%，三组总体比较有差异性(P<0.05)、两两比较肺癌组的表达显著高于另外两组（P<0.0167)。Nanog在早期肺鳞癌的表达显著高于肺腺癌（P<0.05）；Nanog蛋白的表达在低未分化肺癌患者中显著高于高中分化的患者(P<0.05)；同时Nanog的表达与淋巴结有无转移密切相关、有淋巴结转移的肺癌组织中反而Nanog蛋白表达减少、在I期的表达显著（P<0.05）（与II期相比较）；Nanog的表达在其它病理因素（性别、年龄分段、肿块直径大小）中无显著意义（P>0.05）。2.同样Musashi1蛋白在三组间的表达总体比较有统计学意义（P<0.05）；两两组间比较，肺癌组的表达比另外两组增高(P<0.0167)；肺癌中Musashi1的表达水平随着肺癌患者的临床TNM分期、分化越差及有淋巴结转移显著增高（P<0,05），而与肺癌患者其它因素（性别、年龄分段、组织病理类型和肿块大小）无相关性（P>0.05）；Nanog和Musashi1两种蛋白间在肺癌中的表达存在正相关性( r=0.579，P<0.01)。 结论： 1.Nanog和Musashi1蛋白显著表达于早期非小细胞肺癌； 2.两种蛋白的表达随肺癌分期、分化程度及有无淋巴结转移，均存在统计学差异性； 3.Nanog和Musashi1两种蛋白在早期非小细胞肺癌组织中的表达存在相关性； 4.Nanog和Musashi1两种蛋白可以作为非小细胞肺癌诊断靶点，其中Nanog对于非小细胞肺癌患者早期诊断有一定价值，Musashi1意义有限。