民办高校的运行机制既不同于企业，也不同于公办高校，它有着自身的特点和规律。本文选择民办高校的投入多元化作为切入点，从民办高校的产权关系这个视角出发，来研究民办高校的运行机制问题。 文章首先分析了影响民办高校投资办学主体多元化，进而导致产权结构多元化的环境背景因素。多元化产权结构必然要求产权清晰化，在分析了民办高校产权的特点和现实界定中存在的问题后，文章提出了民办高校产权界定的变革思路。在这种多元化的民办高校产权制度安排基础上，文章认为民办高校运行机制的定位是产业化运行机制。产业化运行机制的本质是在国家宏观调控下，使市场机制在资源配置中发挥基础性作用，使民办高校发展成为面向社会，自主办学，自我发展、自我约束的法人办学实体；这种机制的核心是建立规范化的民办高校法人治理结构。最后，为保证民办高校的产业化运行机制能够持续、稳定、有效运转，文章认为要通过法律来规范和保障这种运行机制。