信阳南湾水库翘嘴红鲌和青梢红鲌遗传多样性研究

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翘嘴红鲌(Erythroculter ilishaeformis)和青梢红鲌(Erythroculter dabryi)均属鲌亚科红鲌属鱼类,在我国广泛分布。因其肉质鲜美、营养丰富,被视为我国上等经济鱼类。充分认识翘嘴红鲌、青梢红鲌的遗传多样性水平,对其种质资源的评价、保护与持续利用具有重要意义。本实验采用ISSR分子标记技术对信阳南湾水库翘嘴红鲌、青梢红鲌两群体的遗传多样性进行研究,结果如下:(1)利用正交试验设计方法,对翘嘴红鲌、青梢红鲌的ISSR-PCR反应体系中的DNA模板、Mg2+、引物、dNTPs及Taq DNA聚合酶浓度进行正交优化。建立的25ul最优反应体系为:DNA量90ng、Mg2+1.60mmol/L、引物0.5μmol/L、dNTPs0.4mmol/L、Taq DNA聚合酶1.25U。利用此体系,对反应中的循环次数和退火温度分别进行优化试验,确定反应程序为:94℃预变性5min;94℃变性40s,4758℃复性40s,72℃延伸1.5min,循环次数38;72℃延伸10min。(2)从77个ISSR引物中筛选出15个,对南湾水库翘嘴红鲌、青梢红鲌两群体(共60尾)的基因组DNA进行PCR扩增,其中对翘嘴红鲌共检测出108个位点,多态位点45个,对青梢红鲌共检测出112个位点,多态位点44个。利用POPGENE软件分析翘嘴红鲌、青梢红鲌2个群体的多态位点比例(PPB)分别为41.67%和39.29%,观测等位基因数(Na)分别为1.4167和1.3929,有效等位基因数(Ne)分别为1.2846和1.2716,Nei’s基因多样度(h)分别为0.1641和0.1545,Shannon’s信息指数(I)分别为0.2414和0.2263,遗传相似度(S)为分别0.8302和0.8401,遗传距离(D)分别为0.1872和0.1762。各项指标综合显示,南湾水库翘嘴红鲌、青梢红鲌群体的遗传多样性处于中等水平,翘嘴红鲌遗传多样性略高于青梢红鲌。
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