信息披露和商业秘密保护具有对立统一的一面,如何协调好二者之间的关系,是解决好上市公司信息披露中的商业秘密保护问题的关键。而信息披露中商业秘密保护状况的好坏直接关系着上市公司的良性发展、证券市场秩序的规范以及广大投资者的利益。我国对商业秘密进行法律保护的历史进程还比较短暂,尤其是关于如何加强对上市公司信息披露中的商业秘密保护问题没有给予足够的重视,存在着对信息披露中商业秘密保护不力的情况。各上市公司为了保护自己的商业秘密采取了诸多的所谓“自我保护”手段,虚假披露、模糊陈述、隐瞒重大事项、延迟披露等信息披露违规现象曾出不穷,在损害广大投资者利益的同时,更为严重的是,扰乱了正常的证券市场交易秩序,不利于证券市场的健康发展。加强对上市公司信息披露中的商业秘密保护已迫在眉睫。虽然信息披露与商业秘密保护之间存在着利益与价值上的冲突,但是这种冲突可以通过立法价值的选择以及具体制度的设计来加以协调。在微观的制度设计上,首先应当制定一部统一规范的《商业秘密保护法》。其次,完善我国的信息披露规则,实现“重要性标准”的一元化;健全目前的信息披露豁免制度,引入信息披露豁免澄清制度。再次,完善证券监管制度,切实保护投资者的利益。最后,还要健全《民事诉讼法》、《反不正当竞争法》、《刑法》等相关法律制度,以此增强对上市公司信息披露中商业秘密的保护力度。