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本研究以不同产地铁皮石斛作为试验材料，采用ISSR分子标记技术对铁皮石斛种质的遗传多样性和亲缘关系进行研究，为全面掌握铁皮石斛种质资源遗传背景，筛选和培育优良铁皮石斛品种奠定基础。以其中10个产地铁皮石斛资源为试验材料，采用HPLC-UV法分别构建铁皮石斛茎、叶片指纹图谱，并对铁皮石斛不同部位HPLC指纹图谱进行研究；同时测定10个产地铁皮石斛中主要药用成分含量，研究铁皮石斛主要药用成分随采收时期的变化情况。主要研究结果如下：1运用ISSR分子标记技术对铁皮石斛遗传多样性进行了研究。利用100条ISSR引物筛选出12条多态性引物（占12%），共扩增出167条DNA谱带，其中多态性谱带154条，多态性比率（PPB）为92.21%。利用POPGENE32软件计算得出平均观察等位基因（Na）为1.9701，平均有效等位基因数（Ne）为1.6408，平均Nei’s基因多样性指数（H）为0.3646，平均Shannon’s信息指数（I）为0.5373。利用DPS软件得出20份试验材料的遗传相似系数（GS）范围为0.41~0.82，在聚类分析过程中，铁皮石斛种质聚成一个大类，进一步分析表明，相近地区铁皮石斛种质没有聚在一起。这些结果说明试验收集的材料来源比较复杂，遗传背景丰富。2建立了铁皮石斛资源HPLC指纹图谱研究的方法。色谱条件如下：色谱柱：WatersC18柱（5μm，4.6×250mm），流动相：乙腈-0.05%磷酸（梯度洗脱），流速：0.8mL/min，检测波长：225nm，进样量：20μL，柱温：25℃，检测时间：75min。3得到了分离度较好的铁皮石斛茎、叶片的HPLC指纹图谱。标定了铁皮石斛茎指纹图谱的14个共有峰（9号峰为柚皮素）；标定了叶片的8个共有峰（8号峰为柚皮素）。通过指纹图谱相似度分析表明，不同产地铁皮石斛资源同一部位（茎、叶片）的HPLC指纹图谱具有较高的相似性，不同部位HPLC指纹图谱差异较大。4不同产地铁皮石斛药用成分含量存在显著差异。茎中多糖含量较高的有广西南宁、浙江萧山、浙江杭州，总黄酮含量较高的有浙江萧山和广西南宁，生物碱含量较高的有浙江乐清、浙江瑞安、广西南宁、浙江；叶片中多糖含量较高的有浙江瑞安、浙江、浙江乐清，总黄酮含量较高的有广东饶平和福建龙岩，生物碱含量较高的有广东饶平、福建龙岩、浙江瑞安。5铁皮石斛资源药用成分在不同采收时期有显著差异。多糖和总黄酮含量在3月份较高，生物碱含量在10月份较高。