为探索回阳、养阴生肌机制搭建急慢性创面LncRNA的CNC图

来源 :湖南中医药大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:robotech
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目的:研究急慢性创面特异表达Lnc RNA与m RNA基因功能之间调控网络,为探索回阳、养阴生肌的机制提供理论基础。方法:用基因芯片技术对慢性难愈合创面和急性创面组织的RNA总量进行提取,再挑选出2倍差异及P<0.05Lnc RNA及m RNA进行差异表达分析,得到基因表达谱。将基因表达谱中的m RNAs进行KEGG通路分析,可以发现其中下调及上调最明显的通路,再分别对最明显的通路进行其Pathway Map展示,从而可以明显得到显著m RNA指标,将这些显著m RNA指标进行q-PCR验证,得到有意义的阳性指标后与差异Lnc RNA交集得出Lnc RNA-m RNA共表达网络,并基于Lnc RNA-m RNA共表达网络挑选出不同Lnc RNA进行功能验证。结果:检测差异分析后的基因表达谱,发现上调差异有502个,下调差异有1204个;m RNA分析发现上调差异621个,下调差异505个,KEGG通路分析发现上调和下调的通路均有10条;通过分别对上调、下调最明显的通路进行Pathway Map展示,挑选出显著m RNA指标8个:BMP2、IFNB1、IL6、IL18、PIK3CB、SMAD7、SMAD9、β-actin,分别将其进行q-PCR验证,得到有意义的阳性指标个5个:BMP2、IL6、IL18、PIK3CB、SMAD7,将这5个阳性指标和差异Lnc RNA交集得出Lnc RNA-m RNA共表达网络,并基于Lnc RNA-m RNA共表达网络挑选出不同Lnc RNA进行功能验证。结论:基于Lnc RNA-m RNA共表达网络挑选出的20个Lnc RNA,其在各个领域当中均有不同程度的报道,为后续的功能和机制研究提供了方向和重点,为探索回阳、养阴生肌的机制提供理论基础,为中医药加速慢性难愈合创面愈合的研究提供了新的思路。
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