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第一部分强直性脊柱炎全基因组扫描的Meta分析
目的:综合分析强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)家系的全基因组扫描基因定位的结果,探讨进一步研究和确定AS的遗传易感位点的思路和方法。
方法:采用基因组寻证Meta分析(genome search meta analysis,GSMA)法,对符合该方法分析的4个AS家系的全基因组扫描结果包括参数连锁分析和非参数连锁分析的结果进行分析。根掘连锁分析的最大值被赋值并按降序排列,从而计算出总的等级分值(Rsumrnk)。根据每个研究的受累个体数进行加权GSMA对结果进行修正。本研究共有479个家系,1151个AS患者。总的等级分析概率(Psumrnk)和有序的等级分析概率(Pord)<0.05认为可能含有易感区域,GSMA Psumrnk<0.000417.时,认为在全基因组连锁中有显著意义。
结果:GSMA显示10组结果的Psumrnk和Pord均小于0.05,表明这些组内最可能含有AS的易感基因位点,这些组分别是:6.2,16.3,6.1,3.3,6.3,16.4,10.5,17.1,2.5,2.9。GSMA生成的具有显著意义的全基因组连锁分析的证据位于6p22.3-p21.1(BIN6.2,Psumrnk<0.000417),包含HLA位点。
结论:本GSMA研究进一步证实了HLA位点是AS的主要致病基因易感区域,并初步提供非HLA区域包括16q,3p,10q,2p,17p和2q证据。
第二部分强直性脊柱炎家系遗传模式的研究
目的:探索中国汉族强直性脊柱炎大家系的遗传模式和遗传参数,寻求家系中可能的疾病传递方式。
方法:采用系谱分析和分离分析多元logistic回归模型对3个家系进行遗传模式评估。
结果:在强直性脊柱炎一个大家系中,孟德尔显性遗传(模型Ⅴ多因素+显性与模型Ⅲ-多因素+孟德尔比较),x2=0.06,df=1,p=0.81。
结论:首次证实在中国汉族AS大家系中,该病存在一种常染色体显性遗传的传递模式。
第三部分中国汉族强直性脊柱炎新的致病易感基因区域的研究
目的:通过对中国汉族AS家系的全基因组扫描及后续的精细定位,寻找AS的新的致病易感基因区域。
方法:用382个常染色体微卫星标记对AS家系进行全基因组扫描,并以基因分型结果进行参数连锁分析。参数选择根据大家系的分离分析结果。对有提示连锁位点的区域,进一步在附近一定遗传距离选择更密集的微卫星标记,从而把疾病易感区域缩窄范围,以便为下一步候选基因的筛查提供依据。
结果:家系C的全基因组扫描及精细定位连锁分析结果显示,最高LOD值为4.02(θ=0),在D6S273处获得。家系A和家系B共同定位于2号染色体长臂D2S377-D2S1349这一6cM的区域。两家系最大的异质性LOD值为12.41,其中,A家系的最高LOD值为3.26,而B家系的最高LOD值为2.13,均于D2S2228位点获得。
结论:在中国汉族AS家系中,HLA—B区域是该病致病基因重要的易感区域;并发现2q36是非MHC区外该病新的致病易感基因区域之一。
第四部分中国汉族强直性脊柱炎新的致病基因研究
目的:通过候选基因的测序筛选,寻找AS的新的致病基因,并研究疾病相关的基因功能。
方法:通过测序的方法对家系A和B所在的易感区域内的33个已知基因进行测序寻找突变点。对发现的新的致病基因,采用RNA干扰基因沉默的方法研究疾病相关的基因功能,观察基因沉默后相应的骨代谢指标和炎症指标的变化。
结果:在家系A中发现胰岛素受体底物1(insulin receptor substrate1,IRS1)的一个突变点1738 C→G与疾病共分离。这个突变点在不同物种中高度保守。在IRS1干扰后肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factor—alpha,TNF-α)在MG-63细胞株持续低表达,而在MG-63细胞株观察到转化生长因子β1(transformi ng growth factor beta1,TGF—β1)表达的下调。提示IRS1是可介导或调控TGF—β1基因涉及的功能的基因之一。
结论:IRS1可能是AS家系A的致病基因,可能通过TGFβ1参与疾病的发生。