论文部分内容阅读
白术(Atractylodes macrocephala Koidz.)为菊科苍术属多年生草本植物,是我国出口创汇的十大拳头中药品种之一。番茄(Solanuum lycopersicum Mill.)是茄科蔬菜家族的重要成员,也是深受我国人民喜爱的蔬菜之一。2011-2012年研究者发现白术表现严重的矮化症状；番茄表现出严重的花叶,卷曲,条斑且果实严重腐烂等症状。为明确白术、番茄病毒病病原,通过生物学接种、病毒dsRNA分离技术、非序列依赖性PCR扩增(SIA)、RT-PCR等方法,对其进行系统的病原鉴定,结果如下：(1)通过生物学接种指示植物,初步判定白术、番茄的病害很可能是由病毒引起。(2)以提取的病毒双链RNA (dsRNA)为模板,进行非序列依赖性PCR扩增(SIA),发现山西绛县和河北安国的矮化白术受黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus, CMV)所侵染,并将其命名为CMV-Am;同时发现晋中地区的番茄受(Tobacco mosaic virus, TMV)所侵染,并将其命名为TMV-SXFQ。(3)为进一步明确CMV-Am和TMV-SXFQ的分类地位,对CMV-Am和TMV-SXFQ的全基因组进行RT-PCR扩增。经测序后进行序列比对分析,表明CMV-Am分离物与来自中国北京的Sd株系同源性最高、亲缘关系最近,并将CMV-Am归属于亚组IB; TMV-SXFQ分离物与来自南韩的BSY株系的同源性最高、亲缘关系最近。(4)分别将CMV-Am和TMV-SXFQ所编码的氨基酸序列与其同源性比较高的株系所编码的相应氨基酸序列进行比较发现,Am-RNA1所编码的1a蛋白中存在16个氨基酸的变异；Am-RNA2所编码的2a蛋白中存在9个氨基酸的变异,2b蛋白中存在1个氨基酸的变异；Am-RNA3所编码MP蛋白中存在2个氨基酸的变异,CP蛋白中存在4个氨基酸的变异；TMV-SXFQ所编码的蛋白中,仅在129KDa复制酶蛋白中存在5个氨基酸的变异,通读蛋白中存在6个氨基酸的变异。