老年急性髓系白血病不同危险分层相关的lncRNA的研究

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目的:急性髓系白血病(Acute myeloid leukemia AML)是造血系统恶性肿瘤。在目前标准治疗方法下,约35%-40%的低危年轻AML患者可以治愈。AML是老年人高发的一种恶性血液疾病,中位发病年龄为65~70岁。但因为其具有特殊的临床及生物学特点,化疗缓解率仅为45%,5年生存率仅为10%左右,早期死亡率却高达30%。近年来,虽然针对白血病的研究取得一定的进步,但仍面临着严峻的挑战。长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是指长度超过200个bp的核苷酸,缺乏编码蛋白能力的RNA转录本。LncRNA在人类各种生物学过程中及癌症发生发展过程中具有重要作用。目前,越来越多的研究表明,lncRNA可能在表观遗传学上,转录及转录后水平调控基因的表达。LncRNA可以在多种癌症中异常表达,并发挥着促进和维持肿瘤的发生发展的重要作用,展现了lncRNA可以作为生物标志物和治疗靶点的重要临床潜力。随着测序技术的发展,白血病相关基因日益受到人们的关注,其中lncRNA成为白血病研究的热点。然而,目前对lncRNA作为预测老年(60岁以上)AML患者预后的分子生物标志物相关研究尚不完善。本研究通过对TCGA的相关数据进行分析,筛选差异表达的lncRNA及其下游靶分子,对60岁以上AML人群预后影响的相关信息进行分析。若能深入研究lncRNA在高龄高危AML患者中的发生发展机制,找到适当的lncRNA作为治疗靶点或作为新的个体化治疗的标志,对于预后及治疗都有着非常重要的意义。研究方法:将TCGA数据库中60岁以上AML患者样本,根据NCCN指南分为高危AML和低中危AML两组。通过R软件中的“edgeR”筛选得出差异表达的lncRNA/miRNA/m RNA。再利用R软件中的“survival”包对高危AML与低中危AML中存在差异表达的lncRNA进行生存分析,并构建ceRNA网络,用临床患者标本,利用(Real Time Quantitative PCR,RT-q PCR)技术验证lncRNA患者骨髓标本中的表达情况。结果:根据TCGA数据库中的lncRNA/mi RNA/mRNA表达数据,综合分析得出22个差异lncRNA中,17个lncRNA(AC009154.1,AC011124.1,AC084819.1,AC087258.1,AC092691.1,AC093627.2,AC117402.1,AC144450.1,AL022396.1,AL035691.1,AL138899.1,AL355974.2,AL441943.2,LINC00703,LINC00871,LINC01360,LINC01612)与预后呈负相关性。5个lncRNA(LINC00648,AC103702.2,AC100775.1,AC092484.1,AC091138.1)与预后成正相关性。得到了与这些lncRNA相关的ceRNA网络,进行了两者间差异表达mRNAs的GO和KEGG通路分析。最后,运用RT-qPCR技术验证了我院48例60岁以上32例高危以及16例低中危AML患者骨髓标本,其中AC093627.2存在差异表达(r=0.167,0.918,P<0.05)。结论:AC093627.2在老年高危险AML患者的表达情况明显高于低中危患者。这一差异表达的情况,将有助于预后的判断及治疗的选择。
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