商业银行属于高风险的运营行业，在金融全球化一体化的21世纪，在金融产品不断创新，同业竞争加剧的时代，商业银行的风险管理已经是不得不面对的常态化管理模式了。现行的商业银行的风险管理模式包括内部控制管理和经济资本管理，两者都是以风险管理为目的的管理体系，在商业银行中却处于并行的状态，不仅各自的运行存在诸多的问题，而且加大了风险管理的成本和延缓了风险管理效率，积累了诸多弊端。本文通过对经济资本管理与风险管理、内部控制管理与风险管理理论的分析，认为经济资本管理与内部控制制度有融合的基础；在通过分析我国商业银行现行的风险管理体系中存在的弊端，在融合风险管理理论、经济资本管理理论、委托代理理论、内部控制理论，结合商业银行的风险控制目标和经营目标的基础上，提出建立一个可以覆盖商业银行全面风险管理的有效机制——嵌入式经济资本风险管理体系，将全面风险管理内部控制框架和经济资本管理做互补式有效结合，形成一个全面的商业银行风险管理体系，为商业银行有效的防范风险，创造价值，可持续发展服务。嵌入式的经济资本风险管理理论体系是指商业银行全面风险管理框架下的经济资本风险控制体系，这个体系是将全面风险管理的内部控制框架和经济资本风险管理模式充分融合和互补，以制度为保障，以风险计量为核心，以风险绩效为评价手段，形成动态的、全面的、符合商业银行管理目标的风险管控机制。嵌入式经济资本风险控制体系的目标定位为可容忍风险程度下企业价值最大化，控制结构是将COSO—ERM的结构与经济资本管理流程相结合，在经济资本的计量、配置和绩效评价的每一个环节中，明确风险管理目标，建立全面风险管理要素；考虑到商业银行所面对风险的复杂性和经济资本的虚拟性和不确定性，在设计全面风险管理框架体系的过程中，尝试以风险类别为视角、以经济资本管理流程为视角等不同视角的控制制度融合问题，研究内部控制制度在对经济资本管理中的适用性和可变化性，并以商业银行操作风险为例说明控制流程的设计。在构建嵌入式经济资本全面风险管理的理论体系的基础上，选择我国工商银行的数据为例，对经济资本管理和内部控制制度相结合的理论进行实证研究。实证研究的结果表明：首先，基于内控评价结果修正的基本指标法，从我国商业银行操作风险的主要因素出发，结合商业银行对其自身的操作风险控制能力，计量出了与操作风险相匹配的经济资本，进而对经济资本合理地分配提供了依据，这就构成了度量我国商业银行操作风险的一个有效途径。其次，修正后的操作风险经济资本度量模型能够反映我国商业银行内部控制薄弱的现状，商业银行的管理者可以通过计量结果倒推内部控制中的缺陷，使得操作风险计量的意义得到了延伸。