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本研究采用一向不连续酸性聚丙烯酰胺凝胶电泳(A-PAGE)技术分析小麦高分子量谷蛋白亚基(HMW-GS)组成。用十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)系统分析95个小麦品种的高分子量谷蛋白亚基组成，将这些已知亚基组成的小麦品种在酸性聚丙烯酰胺凝胶电泳系统中分析，用于酸性聚丙烯酰胺凝胶电泳条件的摸索和确定。
酸性聚丙烯酰胺凝胶电泳系统中高分子量谷蛋白亚基的有效提取是非常重要的。本研究用40％正丙醇中去除可溶性蛋白(醇溶蛋白和可溶性谷蛋白)，高分子量谷蛋白亚基在含有0.154％二硫苏糖醇(DTT)的40％正丙醇中提取并还原，然后用0.21％4-乙烯基毗啶烷基化30min。用40％丙酮沉淀谷蛋白，获得高纯度的HMW-GS，HMW-GS在40％正丙醇中重新溶解，并加入等体积含有2M尿素、40％蔗糖、0.01％甲基绿的0.016M乳酸一乳酸钠样品缓冲液(pH2.9)用于电泳分析。对影响HMW-GS在A-PAGE系统中分离的因素进行比较分析，选择乳酸-乳酸钠缓冲液作为A-PAGE的缓冲系统，确定了A-PAGE系统的主要电泳参数。样品在100mm(宽)×130mm(高)×1mm(厚)的聚丙烯酰胺凝胶中600V恒压电泳3小时。蛋白的固定和染色在染色液内同步进行，使试验步骤得到简化。凝胶脱色24小时后，获得了背景清晰的电泳图谱。对比SDS-PAGE，A-PAGE系统中凝胶的聚合速度快，胶体强度适中，电泳谱带清晰，对高分子量谷蛋白亚基有更高的分辨率。
在A-PAGE系统中，高分子量谷蛋白亚基的图谱与SDS-PAGE中的结果非常相似，仅有受Glu-A1控制的亚基迁移的速度比较快。所有的HMW-GS，包括在一些SDS-PAGE系统中较难分离的亚基，如亚基2和2<*>、9和10等，在A-PAGE中均得到了较好的分离效果。根据。HMW-GS在A-PAGE系统中图谱很容易区分不同品种或基因型。因此本试验确定的A-PAGE方法在对高分子量谷蛋白亚基分离、组成分析及品种鉴定中具有较大的应用潜力。