色谱及双向电泳图谱的计算解析方法研究

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计算分析技术是研究药学和生物学领域问题的强有力工具,目前已广泛应用于光谱、色谱和电泳等分析仪器信号解析和信息特征提取研究。但是,在测定复杂药物样品待测成分含量方面,现有计算解析方法的应用尚存困难。另外,在电泳图像蛋白质点识别中,现有计算识别方法易受干扰色斑影响,蛋白质点的正确识别率难以提高。因此,本文围绕着色谱重叠峰解析和蛋白质电泳图像识别相关课题,运用现代仪器分析、信息科学及计算智能等多学科交叉综合技术,进行复杂物质体系的计算分析方法和生物图像信息处理方法研究,其主要内容如下: 1、研究用分离分析、不分离分析与计算解析相融合的新方法解决复杂药物样品体系的含量测定难题,提出将主成分分析法和GRAFA法集成使用,同时改进了经典的IND因子指示函数,在忽略复方制剂中其它成分的情况下,直接对其中未完全分离的待测成分含量进行计算测定。将其用于复方丹参制剂中三七皂苷R1的含量测定,计算分析结果表明,该方法明显优于广义秩消因子法,同时证明IND函数的改进提高了计算分析准确度。 2、研究提出一种识别双向电泳凝胶图谱上蛋白质点的新方法。该方法利用图像上非蛋白色斑与蛋白质点在颜色、面积和形状特征上的差异,将图像锐化增强方法、边缘分析方法和形态特征识别方法集成用于识别双向电泳图谱上的蛋白质点。该方法适用于电泳图谱中非蛋白色斑干扰较严重的区域。将其用于人血清蛋白质组双向电泳图谱蛋白质点识别,结果表明,本方法优于PDQuest7.2中的蛋白质点识别方法,明显降低了蛋白质点的误识别率。 将双向电泳技术与本文提出的蛋白质电泳图谱计算识别方法结合用于分析非肿瘤人群、良性乳腺肿瘤患者和恶性乳腺肿瘤患者的血清蛋白质组表达图谱,发现谷胱甘肽S—转移酶M5在肿瘤患者人群的血清中呈高表达状态。经分析可知,该蛋白与肿瘤发病相关,在肿瘤多药耐药研究上有重要意义。
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