21世纪初，安然等财务舞弊事件的爆发，引发了资本市场对企业内部控制的关注，对内部控制进行审计也进入到人们讨论的范围之内。随着美国萨班斯法案的公布，内部控制审计的执行成为强制性规定。2008年和2010年我国相继颁布了多部有关内部控制审计的规范和指引，标志着内部控制审计正式进入我国。自从内部控制审计产生以后，将内部控制审计与财务报表审计交由同一家会计师事务所进行整合审计，成为业界的普遍共识。但是，目前学者对整合审计的研究停留在审计流程的设计层面上，很少涉及在具体应用时产生的效果和可能存在的问题。在实际审计中，整合审计也存在审计效率不高和效果不佳的状况。本文将研究重点放在整合审计的应用中存在的问题上，并结合案例分析，探索整合审计的质量评价指标。　　文章以会计师事务所执行整合审计业务的流程为研究对象展开研究过程。首先，在现有研究的基础上提出整合审计的测试模型，对整合审计的流程做出一定的改进和完善，并结合内部控制审计与财务报表审计的关系，归纳出了整合审计实施的整合要点，探讨了实施思路、实施流程等问题，还总结出评价整合审计质量的指标。其次，选取Y会计师事务所执行整合审计的案例，按照所提出的审计流程和评价指标，对整合审计的实务操作进行分析。最后，针对整合审计在具体实施过程中存在的问题提出改善建议。　　通过上述研究过程，本文获得以下研究结论。（1）现有多数学者将整合审计流程划分为确定审计目标、制定审计计划、实施审计和完成整合审计报告四个阶段，本文提出应增加一个整合审计完成阶段，并调整内容，形成整合审计流程的三阶段观点，即计划阶段、实施阶段和完成阶段。（2）鉴于初步审计活动对于整合审计的重要性，本文提出应将其纳入流程的前期工作范围，扩展到整合审计计划阶段中。（3）在整合审计的完成阶段，应增加审计质量评价的内容，并按照具体的指标实施评价。（4）结合某事务所的整合审计实务案例研究表明，这些阶段划分及质量指标评价活动具有可行性。