本文主要通过介绍无罪推定原则的涵义及其内在的法律要求来研究该原则对保护被追诉者合法权益的理论及现实意义。目前我国被追诉者往往在未经法院定罪之前就受到有罪的怀疑，从而导致在司法实践中人身权益、财产权益受到不法侵害，这严重破坏了法律的公平与正义。本文首先分析了无罪推定原则的法律涵义，然后运用比较研究的方法，通过介绍域外法中无罪推定原则在保护公民合法权益方面的有益做法，来加深对该原则的理解。在本文的第四章中，运用实证分析的方法，研究了该原则在我国的立法成果、我国被追诉者合法权益缺失的表现等问题。最后，通过归纳总结的方法提出笔者个人对我国发展该原则的法律建构及相关的辅助措施，以期实现对被追诉者权益的维护。本文最大的研究成果就是从理念上着手解决我国被追诉者权益保护的问题，如果在法院未行使审判权以前，将被追诉者至于无罪的位置上，那么目前诸多的不法行为都将被大大的遏止。通过该课题的研究，首先将在理论上为我国的人权保护提供法理上的支撑，使程序正义的理念得以顺利推行，为我国沉默权的建立、辩护权的完善等诸多问题的解决添砖加瓦。并且该原则的确立将在实践中产生巨大的影响，将有力缓解司法实践中非法取证、违法侦查等一系列的司法问题，从而更好地保护公民的合法权益。