以耐盐植物为主体形成的海岸带湿地生态系统,是全球单位面积服务功能最高的生态系统之一。本文对我国从辽宁到海南10个沿海省市大陆及岛屿海岸带耐盐植物广泛采样,从采集获得的样品中筛选出53科97属的116物种共562样品进行DNA条形码研究。对3个叶绿体片段rbtK、cL、trnH-psbA和1个核基因片段ITS进行扩增和测序,统计各个片段的引物通用性和序列获得率。扩增和测序方面,选择使用两对matK引物(matK-390F//matK-1326R和matK3F-KIM/matK IR-KIM)能扩增出所有类群,序列获得率达到89.32%;应用18sdir/ITS4对ITS进行扩增,序列获得率为85.59%。序列相似性分析的结果中单个片段ITS物种识别率最高(73.36%),rbcL的物种识别率最低,仅为46.41%;系统发育树的结果显示matK的物种识别率最好(82.3%)。多维度非度量分析(NMDS)和主坐标分析(PCoA)结果表明在进行海岸带区域性植物的DNA条形码研究时,叶绿体片段和核基因片段均应该考虑。综合上述研究结果,推荐联合片段ITS+matK作为中国海岸带耐盐植物DNA条形码。本文为海岸带耐盐植物研究提供了总计1939条DNA条形码基础数据,为构建耐盐植物DNA条形码数据库奠定了基础。