【摘 要】
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目的:寻找食管癌早期诊断和预后评估的潜在重要功能蛋白,对该基因在食管癌中的表达进行鉴定和验证,以及初步探索该基因在食管癌中的细胞生物学功能。方法:利用生物信息学手段综合分析GEO数据库GSE57630数据集和TCGA数据库中食管癌基因表达数据集,通过DAVID网页工具、Veen图、GEPIA分析工具、Kaplan-Meier生存分析法等方法,对数据进行降维处理后获得差异表达基因,再经过PPI网络互
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目的:寻找食管癌早期诊断和预后评估的潜在重要功能蛋白,对该基因在食管癌中的表达进行鉴定和验证,以及初步探索该基因在食管癌中的细胞生物学功能。方法:利用生物信息学手段综合分析GEO数据库GSE57630数据集和TCGA数据库中食管癌基因表达数据集,通过DAVID网页工具、Veen图、GEPIA分析工具、Kaplan-Meier生存分析法等方法,对数据进行降维处理后获得差异表达基因,再经过PPI网络互作图确定差异基因蛋白之间的关系,进而锁定目的基因。利用公共数据库和文献检索对目的基因进行全面的了解,初步预测其可能具有的功能。随后,通过细胞因子芯片AAH-BLG-1000个检测位点进行临床食管癌患者外周血清标本的检测,初步验证目的基因在食管癌中的表达情况。最后,构建目的基因质粒过表达的食管癌细胞KYSE150和食管癌细胞KYSE180的表达模型,分别对其进行细胞划痕愈合实验、CCK8增殖实验、克隆形成实验、Transwell细胞迁移和侵袭实验以及基质胶共培养实验,分析目的基因对食管癌细胞行为的影响,在细胞层面上对目的基因进行再次验证。结果:通过对GSE57630数据集和TCGA食管癌数据集进行综合分析后,SAA1在食管癌中的表达水平上调,可能与食管癌早期诊断和预后评估相关,是研究食管癌的重要功能蛋白。生物信息学分析表明:SAA1不仅在食管癌中高水平表达,而且SAA1的高水平表达与患者的预后不良有密切的关系,即食管癌患者体内高水平表达SAA1则其预后结局更差（P＜0.05）。随后,我们通过细胞因子芯片结果证实,SAA1与LCN2在食管癌患者的外周血清中共同高水平表达,检测结果具有统计学差异（P＜0.05）。最后,通过体外细胞实验,发现SAA1能够对食管癌细胞KYSE150和KYSE180的细胞行为产生影响,表现为:细胞划痕愈合实验、Transwell迁移和侵袭实验、基质胶共培养实验的结果均显示了SAA1对食管癌细胞KYSE150和KYSE180的移动侵袭能力具有显著的促进作用（P＜0.01）;细胞克隆形成实验和CCK8增殖实验的结果均显示了SAA1对食管癌细胞KYSE150和KYSE180的增殖能力也同样具有明显的促进作用（P＜0.05）。结论:通过生物信息学综合分析,SAA1在食管癌中高水平表达并且与预后不良密切相关,体外实验显示能够显著增强食管癌细胞的移动侵袭能力和增殖能力,对食管癌细胞行为产生实质性的干扰,这说明了在一定程度上,SAA1可能与食管癌恶性病变的进展存在相关关系,可能对食管癌疾病的发生发展过程起着重要的推动作用,提示SAA1能够作为研究食管癌早期诊断和预后评估的新的重要功能蛋白。
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