耐甲氧西林金黄色葡萄球菌分子流行病学特征及其变化趋势

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背景耐甲氧西林金黄色葡萄球球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)是临床上重要的耐药菌之一,给患者造成严重的安全威胁。MRSA耐药性和时空分布的多态性给感染诊治造成极大的困难,明确MRSA在不同地区随时间变化的分子流行病学特征及其变化趋势,对MRSA的防控和治疗至关重要。研究对象与方法收集2012年1月至2018年12月浙江某三级甲等医院所有无菌体液来源的MRSA菌株共162株,并将所有菌株根据标准区分为社区获得性(community-associated)MRSA(CA-MRSA)和医院获得性(hospital-associated)MRSA(HA-MRSA)。检测菌株的药物敏感性,通过聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)测定MRSA菌株的多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST),确定葡萄球菌盒式染色体序列(Staphylococcal chromosome cassette mec,SCCmec)、葡萄球菌A蛋白(Staphylococcal protein A,spa)基因多态性,以及杀白细胞毒素(Panton-Valentine leucocidin,PVL),从而探讨耐甲氧西林金黄色葡萄球菌在本地区的分子流行病学特征和历年变化趋势。结果162株菌株经鉴定后符合头孢西丁耐药以及存在mec A基因,被鉴定为MRSA菌株并纳入本研究。其中,140株(86.4%)为HA-MRSA,22株(13.6%)为CA-MRSA。结果显示162株MRSA中共发现16种不同ST型和30种spa型,ST型以ST5(96/162,59.3%)为主,spa型以t311(83/162,51.2%)为主。MRSA共表现出5种SCCmec类型,以SCCmec II型为主(101/162,61.7%)。ST5-II-t311是本地区的第一流行MRSA克隆。2012-2018年间,MRSA的ST型别从2012年的4种增多至2018年的10种,逐渐多样化,2014-2018年ST5 MRSA患病率总体呈下降趋势,而ST59MRSA患病率总体呈现上升趋势,同时发现家畜相关耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(livestock-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus,LA-MRSA)克隆ST398和ST9。此外,162株MRSA菌株中有28株发现PVL基因阳性(28/162,17.3%),最常见的PVL阳性克隆为ST59-IVa-t437 MRSA。与HA-MRSA相比,CA-MRSA中ST5型的比率较低(9.1%vs.67.1%,P=0.000),ST59型的比率较高(63.6%vs.11.4%,P=0.000),PVL基因阳性概率较高(36.4%vs.14.3%,P=0.028)。结论随着时间的推移,MRSA的分子类型越来越多样化。ST5-II-t311是本地区MRSA的优势克隆,但在2014-2018年呈下降趋势,而社区相关性克隆菌株ST59型MRSA,在2014-2018年呈逐年上升趋势。
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