农业是关系国计民生的产业，对于其他产业具有正的外部效应，因此世界各国都非常重视农业的发展。伴随着我国经济的高速发展，我国农产品贸易的地位有所下降，同时，我国农产品贸易也呈现了“大出大进”的特点，2004年以来我国农产品贸易连续出现大幅贸易逆差。面对加入WTO的新的国际环境，我们有必要重新思考下我国农产品比较优势和国际竞争力。日本曾经一度是世界上最大农产品进口国，2001年后，日本排名美国之后，成为世界第二大农产品进口国，但依旧是亚洲地区最大农产品进口市场，也是我国农产品最重要的出口目的国。本文采用历史比较法来分析我国，日本，美国从1990-2005年在日本市场农产品贸易变化情况，利用显示性比较优势指数，贸易专业化程度指数，相对贸易优势指数，以及贸易关系指数来测算以上三国在农产品整体、各具体项目农产品中的比较优势和贸易关系，经过测算发现，我国农产品比较优势集中在劳动密集型产品，比如肉制品(包含水海产品)，水果、蔬菜产品和谷物制品，尽管我们在土地密集产品如谷物类中缺乏明显比较优势，但谷物加工类型产品我国优势明显，说明我们可以通过发展土地密集型产品的加工业来提高比较优势和竞争力。文章也还采用了经济计量学方法来分析日本市场上影响我国农产品出口的因素，以及我国农产品进口是否因为加入WTO而受到很大影响，以此来预测未来我国农产品贸易的发展情况。其中我国农产品未来发展的一个总的趋势应该是继续保持“大出大进”的贸易格局。文章分析了我国农业发展自身存在的优势与劣势，为当前新形势下更充分发挥我国农产品比较优势，提升农产品国际竞争力提供了政策建议。