3号染色体短臂抑癌基因CpG岛甲基化表型(CIMP)及hOGG1基因变异与非小细胞肺癌关系的研究

来源 :苏州大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:wwtmw
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目的:研究3号染色体短臂(3p)相关抑癌基因CpG岛甲基化表型(CIMP),及hOGG1基因变异与非小细胞肺癌(NSCLC)患病关系,以作为早期诊断非小细胞肺癌和评估预后生存情况的生物学指标。方法:1:对4株NSCLC细胞株(SPC-A-1,A549,95-D和LTEP-α-2)进行培养;细胞去甲基化效应由5-杂氮-2′-脱氧胞苷酸(5-aza-CdR)处理;MTT法检测细胞增殖;对80例NSCLC患者和无肿瘤历史的正常对照外周血(PBMC)样本进行3号染色体短臂抑癌基因CpG岛甲基化表型(3pCIMP)分析,3pCIMP指的是每份样本中有3个或多于3个3号染色体相关抑癌基因同时甲基化,甲基化特异性PCR(MSP)检测6个基因的甲基化状态,2:Haploview software V4.1软件分析选取hOGG1基因htSNP,RFLP和SSCP法对117例非小细胞肺癌外周血样本和121例无肿瘤历史正常对照外周血样本进行基因分型,然后进行单倍型分析;对5株NSCLC细胞株(SPC-A-1,A549,95-D,NCI-H460和LTEP-α-2)进行培养,5-杂氮-2′-脱氧胞苷酸(5-aza-CdR)去甲基化处理并收集DNA和RNA,117对NSCLC患者肿瘤组织样本和匹配的非肿瘤组织样本进行hOGG1基因甲基化分析,以上结果最终通过Logistic回归分析对性别、年龄、吸烟史进行校正。结果:去甲基化实验显示3pCIMP状态在NSCLC细胞增殖中起到了重要作用,NSCLC患者外周血样本中有97.5%样本3号染色体短臂(3p)上6个基因中(hOGG1, RAR-B, SEMA3B, RASSF1A, BLU, FHIT)任一基因的甲基化。让人感兴趣的是,NSCLC的PBMC样本中3pCIMP+为43.8%但是在正常对照的PBMC样本中仅有6.3%。以上数据显示3pCIMP状态在NSCLC和正常对照中有显著差异(P<0.001)。更重要的是,结果进一步表明在中国人群中,3pCIMP阳性携带者非小细肺癌患病风险增加了12.8倍(校正后OR,12.8;95%CI, 4.38-37.4,P<0.001)。117例NSCLC外周血样本和121例正常对照外周血样本中hOGG1基因多态性分析无显著差异,但让人感兴趣的是,5株非小细胞肺癌细胞株经去甲基化药物处理前后,hOGG1基因甲基化状态发生了变化,其中3株细胞在去甲基化药物处理前后mRNA表达有显著差异;进一步对117例NSCLC和配对的非肿瘤组织样本中hOGG1基因甲基化状态检测显示,NSCLC中hOGG1基因甲基化频率相比配对的非肿瘤组织更为频繁(68.38%对40.17%,P < 0.001);此外,进一步的结果分析显示,hOGG1基因甲基化可能和肺鳞癌相关(P=0.022)。结论:在现有研究领域中,我们的研究结果第一次显示外周血的3pCIMP状态和非小细胞肺癌患病风险增加相关; hOGG1的甲基化状态可能是其mRNA表达下调的重要因素。
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