农村信用社成立60多年来，一直在服务“三农”、支持地方经济发展等方面发挥着金融主力军的重要作用。多年来，尽管农信社的业务发展突飞猛进，但内部控制制度建设却略显滞后，风险防范存在较多漏洞，导致近年来部分农村信用社内部控制案件频发，给信用社造成了巨大的资金损失，而涉及内控管理的问题还居高不下，严重影响了农村信用社的良好社会形象。所以本文就采用文献检索法、案例分析法、专家访谈法、客户调查法以及定性分析与定量分析相结合的方法等等对农村信用社的内部控制制度展开深入系统的研究。本文研究发现农村信用社内部控制建设中思想观念、制度制定、制度贯彻执行、监督约束等方面都存在诸多问题，如员工思想道德建设落后，守法合规意识较差；内控建设滞后于业务发展，缺乏一整套比较全面、系统、科学的制度架构；制度执行力落实不到位，部分人员还存在“习惯代替制度”的错误做法，内部控制执行流于形式；监督约束机制明显不足；“重业务、轻管理”，内控文化建设落后等等。本文结合农村信用社内部控制建设的现状，深刻分析典型案件的发生，深挖根源，剖析产生问题的内外部原因，借鉴国内外的先进内部控制制度建设体系，提出完善农村信用社内部控制制度建设的有效措施，如加强思想教育，增强综合素质，提高合规意识；完善制度，确保业务操作有据可依；强化制度执行力度，确保制度落实到位；建立健全监督约束机制，努力建设有效的内部控制体系框架，争取为今后农村信用社的健康发展提供强有力的内部控制保障。