ccr5、vif和pol基因的人工miRNA的构建与筛选

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背景及目的:RNAi在HIV-1的治疗研究中得到了广泛的应用,构建高效并且安全的RNAi抗病毒元件是开展相关研究的基础。siRNAs或miRNAs可以特异地结合靶mRNA,引起靶mRNA降解或翻译抑制,最终导致基因特异性沉默。辅助受体(CCR5或CXCR4)是HIV进入被感染细胞所必需的。研究发现,基因CCR5delta32序列缺失可以减缓或抵抗HIV-1感染,但机体未出现免疫异常。基因vif是感染性因子,可能影响游离HIV感染性、病毒体的产生和体内传播。基因pol编码多种酶,如逆转录酶,蛋白酶,对HIV的复制有重要作用。本实验分别以ccr5,vif,pol为靶基因,构建miRNA,从中筛选出来基因效率较高的miRNAs。方法:第一步,选择保守型较好的ccr5,vif,pol基因为靶区,合成基因序列,克隆入载体,转染293T细胞,最后通过qPCR筛选高效表达ccr5、vif和pol基因的293T细胞。第二步,根据基因序列设计引物并分别合成针对ccr5、vif和pol基因的人工miRNA各4对。第三步,以天然miR-155为基础骨架构建了分别靶向ccr5,vif,pol的人工miRNA元件,通过与HIV-1感染性克隆质粒的共转染抑制实验验证获得了可有效抑制HIV-1表达的人工miRNA元件。通过与携带靶序列的报告质粒的共转染实验证明ccr5-miRNA,vif-miRNA和pol-miRNA具有良好的沉默效果。结果:通过干扰效果评价,得到了干扰效果较强的ccr5-miRNA、vif-miRNA和pol-miRNA,其对靶基因的干扰效果分别达到了72%、68%和76%。结论:得到了高效表达ccr5,vif,pol基因的293T细胞;构建和筛选到了各种基因沉默效率最好的miRNA,其干扰效率分别为72%、68%和76%。
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