植物内生菌是一个多样性十分丰富的微生物类群,分布于没有外在感染症状的健康植物组织内,并与宿主植物协同进化。近年来,随着研究领域的不断拓宽和研究方法的不断深入,植物内生菌的生态和生理作用及其作为潜在的生防资源和外源基因载体,在农业和医药领域中的巨大应用潜力,已逐渐成为国内外研究的热点,内生细菌生物制剂成为未来的一个研究发展方向。本实验室分离鉴定的植物内生枯草芽孢杆菌BS2和解淀粉芽孢杆菌TB2菌株是对多种植物具有促生和防病作用的植物内生细菌,具有广阔的应用前景。为了了解内生细菌在植物体内的定殖、活动能力及作用方式,本研究利用编码绿色荧光蛋白的gfp基因对内生细菌菌株BS2和TB2进行荧光标记。通过标记菌表达的绿色荧光来监测内生细菌在植物组织的定殖活动,并对标记菌株的生物学特性及菌株标记前后的生防功能和定殖能力进行比较研究。利用枯草芽孢杆菌168菌株rpsD基因的启动子替换质粒pGFP4412中蜡状芽孢杆菌4412启动子,从而构建了能表达绿色荧光蛋白基因的穿梭载体pS4GFP,将其导入内生细菌BS2和TB2菌株中,利用gfp基因表达后菌落在荧光显微镜下发出的绿色荧光,得到高效表达GFP的标记菌,分别命名为BS2-gfp和TB2-gfp。标记菌生理生化研究结果表明,与出发菌BS2和TB2比较,两个标记菌株均出现了生长滞后的现象;出发菌和标记菌对真菌的抑菌效果比较分析发现,菌株标记前后拮抗活性无显著变化;菌株标记前后在植物体内定殖数量的比较分析结果表明,标记菌株在植物体内定殖菌量稍低于出发菌株。经过对以上几个方面的测定分析显示,本实验构建的标记系统对目标菌株的生长代谢、拮抗能力等方面的影响不是很大,可以满足进一步实验的要求。为了研究内生细菌的侵染定殖机制,我们克隆了来自内生细菌BS2和TB2的纤维素酶基因和果胶酶基因,并对这两个基因是否在内生细菌进入植物体内这一过程中起作用进行了探讨。首先,我们分别从内生细菌BS2和TB2中克隆到了β-1,4-内切葡聚糖酶基因的ORF。对这两个β-1,4-内切葡聚糖酶基因的ORF及其氨基酸序列进行分析,结果表明:两基因的ORF全长均为1500 bp,编码499个氨基酸,分子量都约为55 kDa,菌株BS2等电点为7.49,TB2等电点为7.83。Blast同源性分析结果表明,两个β-1,4-内切葡聚糖酶基因的核苷酸序列同源性和氨基酸序列同源性都为99%。两基因的核苷酸序列只有一个碱基差异,即BS2中1015位是A ,TB2中是G。相应位置的氨基酸由BS2中的组氨酸变成了TB2中的精氨酸。另外,两基因的序列与枯草芽孢杆菌标准菌株BS168的β-1,4-内切葡聚糖酶基因比对结果表明,核苷酸序列同源性与氨基酸序列同源性均为93%。使用pET-29a(+)载体,我们成功地表达了这两个β-1,4-内切葡聚糖酶,SDS-PAGE电泳在59 kDa左右有融合蛋白带,与推算的结果一致。同时研究了该酶的生物学特性,实验结果表明:两个β-1,4-内切葡聚糖酶的最适反应pH均为6.4,属于中性纤维素酶,且酶的pH稳定范围较宽,pH 5.4~9都较稳定。酶的最适反应温度为50℃左右,当温度高于55℃后酶活急剧下降,65℃时酶活仅为50℃时的31%。为了探明来自内生细菌的β-1,4-内切葡聚糖酶基因与内生细菌进入植物之间的关系,我们使用穿梭载体构建了组成型表达β-1,4-内切葡聚糖酶基因的载体,转入野生菌中,得到过表达突变体。同时使用具有单交换功能的整合载体pMUTIN-GFP+构建敲除载体,转入野生菌中,得到低量表达突变体。进一步将过表达载体转入低量表达突变体中获得β-1,4-内切葡聚糖酶基因互补突变体。将不同突变体的菌液对小白菜进行灌根接种,然后对小白菜不同组织内的内生细菌菌量进行不同时间的分离,观察分离情况。分离结果表明:过表达突变体在植物体内的定殖数量明显高于低量表达突变体和标记菌株。其中低量表达突变体在植物体内的定殖数量最低,而互补突变体的定殖数量与过表达突变体基本一致,且明显高于标记菌株。以上结果表明内生细菌产生的β-1,4-内切葡聚糖酶在内生细菌进入植物的过程中起着重要作用。其次,我们还分别克隆了来自内生细菌BS2和TB2的果胶酶基因。对两个果胶酶基因的核苷酸序列及其推测的氨基酸序列进行分析,结果表明:克隆到的果胶酶基因由启动子区域和1266 bp的ORF区域构成,对两个果胶酶基因的ORF同源性分析结果表明,两个果胶酶基因的核苷酸序列同源性和氨基酸序列同源性都为99%,与枯草芽孢杆菌标准菌株BS168的核苷酸序列同源性与氨基酸序列同源性均为72%。与其他已报道的枯草芽孢杆菌及地衣芽孢杆菌的果胶酶基因同源性均低于72%。使用pET-30a(+)载体,我们成功地表达了这两个果胶酶,SDS-PAGE电泳在50 kDa左右有融合蛋白带,与推算的结果一致。为了探明来自内生细菌的果胶酶基因与内生细菌进入植物之间的关系,我们将带启动子的全长果胶酶基因与穿梭载体连接构建了过表达载体,转入野生菌中,筛选得到果胶酶过表达突变体。将过表达突变体与标记菌株的菌液对小白菜进行灌根接种,然后于不同时间对小白菜不同组织内的内生细菌菌量进行分离统计。分离结果表明:在侵入小白菜体内的初期,过表达突变体在小白菜体内的定殖菌量明显高于标记菌株,随着时间的推移,两者之间的定殖数量逐渐变得不明显。要想更明确地弄清果胶酶的功能,还需要进一步的研究。综合全部实验结果,我们得出结论:β-1,4-内切葡聚糖酶在内生细菌中是保守的,是帮助内生细菌定殖植物体内的重要因素之一。同时,对于内生细菌产生的果胶酶,初步分析表明它在内生细菌进入植物体内初期起着关键性的作用。