非营利组织起源于上世纪后半期，从公共管理范围上的意义来讲，不属于“第一部门”（政府）以及“第二部门”（企业），在公共管理学术界中被称为“第三部门”，独立于政府和企业之外，依靠政府资助、企业捐助等非营利性的收益，致力于政府和企业无能为力或不常做的各类社会公共服务。因此，政府、企业和非营利组织之间通过跨部门合作来共同解决诸如经济、商业、医疗、贫穷、建设和环保等问题。不论是在西方发达国家，还是发展中国家，跨部门合作都变得越来越重要和广泛，尤其是企业与非营利组织之间的跨部门合作受到了前所未有地关注。
　　本文首先在跨部门合作的大背景下，结合案例针对合作模式的优势和可行性展开论述。企业可以通过与非营利组织建立合作，拓宽企业的公共关系，提高企业公民身份，创造企业在市场竞争中的优势和经济利益，提高企业的社会责任感。非营利组织在企业身上获得的捐助，可以有效地填补政府援助的不足和社会公众对社会公共服务需求的日渐增长，使非营利组织收入的来源变得更加多元，范围更加广泛，有助于克服对政府资助的依懒性，还可以通过媒体宣传，提高公众信誉度和社会认知度。而且可以通过部门间的资源转移，例如通过学习企业的管理和运营模式来获取更多的利益，提高整体运营效率。
　　合作中机遇与风险总是同时存在的，随后本文借鉴西方发达国家跨部门合作的成功经验，分析中国企业与非营利组织合作中可能出现的风险，例如“非营利组织失灵”和“志愿失灵”的问题正在以各种形式表现出来，利益地诱惑、道德的迷失、公信的腐败等，均会给双方造成极大的损失。进而研究探讨风险防范措施，以期能为企业与非营利组织跨部门合作的理论研究与决策发展提供参考和依据。