随着环境问题的重要性日益增强,以及我国行政体制改革的深入,环保部门是否实行垂直管理体制越发成为人们关注的焦点。我国环保部门目前基本按照行政区划设置,实行以块为主、条块结合的行政体制,属于地方政府的职能部门。在这种体制下,环保部门受制于地方政府和行政区划,难以有效应对环境问题。本文首先从分析我国现行的环保行政体制出发,利用历史研究、实地研究、文献研究、比较研究等研究方法说明垂直管理体制具有强调中央集权,适用于亟需加强市场监管的国家等特点；再列举我国环保部门应当实行垂直管理体制的理论依据和现实条件,垂直管理体制在环境保护方面的正效应,及地方环保部门的有关实践等内容；最后进一步阐述环保部门的体制改革,除了建立合适的垂直管理制度外,还需要合理划分环保行政权限,同时完善环保问责制度、环保政绩考核制度、地方人大的监督制度和公民参与的监督制度,并修改有关法律法规作为保障。