SNP rs2257440影响食管癌细胞DcR3基因表达的机制研究

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研究背景:食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)是一种恶性消化道肿瘤,尤其在我国十分常见,其发病率及死亡率都呈逐年升高的趋势。其预后差,5年生存率仅有20%左右,为高致死性疾病。因此研究其发病机制,寻找新的早期诊断及治疗的靶点具有十分重要的意义。DcR3(Decoy receptor3,诱骗受体3)又称为TNFRSF6B(Tumour necrosis factorreceptor super family member6B,肿瘤坏死因子受体超家族成员6B)。该超家族成员通常能促进机体杀伤并清除肿瘤细胞,例如Fas与其配体FasL(TNFSF6)相互作用介导凋亡为体内最常见的凋亡介导模式之一,在机体的免疫监视及肿瘤自身的清除中起着重要作用。与家族里其他分子不同,DcR3并不促进肿瘤的清除,反而拮抗其他分子诱导的细胞凋亡。其原因是DcR3缺乏跨膜区和膜内信号功能区,属分泌蛋白,可以竞争性结合肿瘤坏死因子,但不能向瘤细胞内部传递凋亡诱导信号[1]。这种现象被认为是肿瘤诱骗(decoy)免疫杀伤细胞而逃脱机体免疫监视的重要机制。迄今,至少已发现有3种与肿瘤凋亡相关的重要配体分子FasL,LIGHT和TL1A介导的细胞死亡受到DcR3的拮抗。抑制DcR3的表达可明显促进上述分子对肿瘤细胞的凋亡效应,而诱导DcR3的表达则可以抑制肿瘤细胞的凋亡,促进肿瘤的存活[2][3][4]。多个临床研究发现,正常组织不表达或低表达DcR3,而肿瘤组织高表达DcR3,其高表达程度与肿瘤的发生发展密切相关[5][6][7]。在前期实验中我们检测分析了DcR3表达水平与ESCC发病率的相关性。结果发现,ESCC患者肿瘤组织DcR3表达丰度显著高于正常对照组织,并且DcR3的高表达与ESCC的侵袭和转移相关,提示DcR3的表达增高可能是ESCC发生发展的重要原因之一[8]。进一步,我们进行了DcR3调控区域内SNP多态性与ESCC发病率的关联研究,结果显示,位于DcR3第一外显子区域的SNP rs2257440与ESCC患病率显著相关,提示rs2257440多态性可能通过调控DcR3表达进而影响ESCC患病风险[9]。综合上述关联性研究结果,我们推测:SNP rs2257440为功能性SNP,即rs2257440不同等位基因可能通过影响DcR3基因的表达,最终参与了ESCC的发生发展。为深入阐明SNP rs2257440多态性影响DcR3基因表达的分子机制,我们对SNPrs2257440位点所在区域进行了生物信息学分析。rs2257440位于DcR3第一外显子区域,而基因的调控元件并不仅仅局限于启动子区,在内含子、第一外显子、3’UTR等区域都可能存在影响基因表达的调控元件。已有文献报道,这些区域内的SNP位点可通过与转录因子的结合参与基因的转录调控[10][11][12]。因此,我们利用TESS(Transcription Element Search System)对rs2257440所在DNA序列进行转录因子结合位点的预测,发现其处在金属反应转录因子1(Metal-responsive transcription factor-1,MTF-1)的结合位点上。因此我们推测转录因子MTF-1可能与rs2257440所在DNA序列相互作用而影响DcR3的表达,进而影响ESCC对抗机体的凋亡诱导而逃避免疫杀伤的能力。研究目的:因此,本课题的研究目的旨在探讨rs2257440位点对DcR3基因表达的等位特异性顺式调控作用及其机制。为此,本课题首先构建了含有rs2257440不同等位基因(C/T)的报告基因质粒以及转录因子MTF-1真核表达载体,通过荧光素酶报告基因试验,以明确rs2257440是否为功能性SNP,MTF-1是否与rs2257440位点不同等位基因相互作用而影响基因的表达。进一步转染MTF-1真核表达载体到rs2257440等位基因型不同的食管癌细胞中,检测细胞中DcR3分子的mRNA和蛋白质表达量,以明确MTF-1是否能在细胞水平促进DcR3的表达,且具有等位基因特异性。最后转染MTF-1真核表达载体到rs2257440不同等位基因型食管癌细胞中,以明确过表达MTF-1是否会对rs2257440不同等位基因型食管癌细胞的生物学行为产生差异性影响。方法:第一部分:MTF-1与SNPrs2257440不同等位基因相互作用影响DcR3基因的表达1.构建报告基因质粒:测定教研室现有的食管癌细胞株中rs2257440位点的等位基因型,以该位点为杂合子的细胞株基因组DNA为模板,通过PCR扩增出含有rs2257440不同等位基因(C/T)的DNA片段并构建到质粒PGL3-Basic上,分别命名为PGL3-440BC和PGL3-440BT。2.构建MTF-1真核表达载体:以食管癌EC109细胞的cDNA为模版,PCR扩增出MTF-1的CDS区,构建到质粒pcDNA3.1上,命名为pcDNA3.1-MTF-1。3.双荧光素酶报告基因实验:1)分别转染PGL3-Basic、 PGL3-440BC和PGL3-440BT入EC109细胞,检测细胞相对荧光活性;2)分别共转染pcDNA3.1-MTF-1和上述报告基因质粒入EC109细胞,检测在过表达MTF-1的情况下,细胞相对荧光活性是否改变。4.为探讨rs2257440不同等位基因对DcR3基因表达的影响,本课题选用两株不同的食管癌细胞(EC109和KYSE450)作为实验对象(两株细胞的rs2257440等位基因型不同,EC109为CC,KYSE450为CT)。pcDNA3.1-MTF-1分别转染EC109和KYSE450细胞,采用定量PCR和Western-blot检测细胞中DcR3基因的表达情况。第二部分:MTF-1对SNP rs2257440不同等位基因型食管癌细胞生物功能的影响pcDNA3.1-MTF-1分别转染食管癌细胞EC109(rs2257440为CC)和KYSE450(rs2257440为CT),采用CCK8法、流式细胞术、Edu染色等方法研究过表达MTF-1对rs2257440不同等位基因型食管癌细胞生物学行为的影响。结果:第一部分:MTF-1与SNPrs2257440不同等位基因相互作用影响DcR3基因的表达1.相对于转染PGL3-Basic的对照组,转染PGL3-440BT的细胞的相对荧光活性显著增加,而转染PGL3-440BC的细胞的相对荧光活性未见明显差异。2.共转染pcDNA3.1-MTF-1和PGL3-440BT的细胞的相对荧光活性升高5.9倍,明显高于共转染pcDNA3.1-MTF-1和PGL3-440BC的细胞以及共转染pcDNA3.1-MTF-1和PGL3-Basic的对照组细胞。3.在食管癌KYSE450细胞中,过表达MTF-1促进了DcR3基因的表达,而在食管癌EC109细胞中未发现这一现象。这一结果与报告基因实验结果一致,即转录因子MTF-1与rs2257440不同等位基因相互作用而影响DcR3的表达。第二部分:MTF-1对SNP rs2257440不同等位基因型食管癌细胞生物功能的影响在EC109细胞中过表达MTF-1,可促进细胞生长,抑制细胞的凋亡,诱导细胞G1到S期转换,但对细胞的迁移能力影响不显著。而在KYSE450细胞中上调MTF-1表达量,同样有促进细胞生长和抑制细胞凋亡的作用,但与EC109细胞不同的是,其诱导KYSE450细胞S期到G2期转换,且可明显促进KYSE450细胞的迁移能力。结论:本课题实验结果提示:1)SNP rs2257440为一功能性SNP位点,其T等位基因能与特定的转录因子MTF-1相互作用而影响DcR3基因的表达。2)MTF-1对rs2257440不同等位基因型食管癌细胞生物功能具有差异性影响,过表达MTF-1能明显促进rs2257440为CT的KYSE450细胞的迁移能力,而对rs2257440为CC的EC109细胞的迁移能力无显著影响。
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