R&D活动对企业发展的重要性不言而喻。通过R&D投资可以使企业获得技术优势,企业通过R&D投入能有效减低现有产品成本或推出更有竞争力的新产品以适应市场的需求。获取更大的经济效益。然而由于R&D投入相对其他投资如固定资产投资来说具有其特殊性,使得R&D投入中的委托——代理问题尤其明显。因此研究R&D与公司绩效关系很有意义。在考虑代理成本时,资本结构是一个非常关键的变量。理论分析表明,资本结构会影响R&D支出与企业绩效的关系。本文的研究目的有三个:1)探讨R&D支出与企业绩效的关系;2)探讨资本结构作为解释变量而非通常研究中的控制变量与企业绩效的关系;3)考察R&D支出与企业绩效之间的关系是否受到公司资本结构的影响。　　本文采用中国上市公司典型R&D支出企业样本,采用相关分析、多元回归分析,面板门槛模型,在理论分析企业资本结构、R&D与公司绩效的基础上进行实证,初步实证结论表明,企业R&D支出对企业的绩效有显著的正向作用;企业的资本结构与企业的绩效存在显著的倒“U”关系;在把资本结构与R&D交乘项加入回归模型中,发现其系数为正,但未表现出统计上的显著性,这说明资本结构会影响企业R&D支出与公司绩效的关系,但影响方向不定,资本结构对R&D与公司绩效的影响可能并非简单的线性关系,也是进行门槛回归的初步证据。进一步的分析表明,企业在不同的资本结构下R&D支出对企业未来绩效表现呈现出门槛效应。当企业的资本结构低于0.466时,企业的R&D投资对企业绩效(托宾Q)有显著的正向作用,解释为此时企业以自有资金支持R&D投资,代理成本较小,R&D投资得到市场认可;当企业的资本结构处在0.466与0.651之间时,此时企业的R&D支出对企业绩效的影响由正转负,这种资本结构下企业需依靠一部分外来资金支撑R&D投资,此时企业的代理成本增加,R&D投资未被市场完全认可;当企业资本结构大于0.651时,此时R&D投资对公司的绩效显著为负,且影响急剧增加。此时企业完全以借债支持R&D投资,企业的代理成本急剧增加,完全抵消了R&D投资对公司绩效的正面作用。我们又把上市公司的样本分为民营企业和非民营企业两类,以此检验这种效应是否分别存在于这两大类样本中。实证的结果表明,R&D对公司绩效的作用在这两类公司中同样受不同资本结构的影响,且这种效应在民营企业中的表现高于国有企业。　　基于本文所得研究结论,文中提出政策建议1)设立政府创新基金。2)利用资本市场的融资来进行R&D投入以降低负债结构的负面影响。3)加大对民营企业的创新政策及资金支持。