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水稻作为世界上最主要的粮食作物,其产量提高受到广大的关注。理想株型可以通过提高水稻单产而增加水稻的产量。分蘖角度和分蘖数是水稻株型构成的两个重要要素,分别与水稻的种植密度和有效穗数紧密相关,是提高水稻产量的重要农艺性状。我们在药用野生稻与栽培稻的野栽交可育后代中发现了散生性状的自发突变体。在散生自发突变体自交F2群体中,本实验随机选择散生性状和直立性状植株DNA构建混池进行重测序,对控制表型的相关基因进行初步定位,然后通过隐性分析法(RCA),运用SSR、InDel等分子标记,对散生基因LAZY3进行精细定位。结果如下:(1)突变体表型特征及农艺性状统计分析:直立性状植株分蘖角度接近零度,散生性状植株分蘖角度接近30度;直立性状植株分蘖数较散生性状植株增多(P<0.01);直立性状植株百粒重极显著低于散生性状植株(P<0.01),总粒重极显著高于散生性状植株(P<0.01);直立性状植株穗长与散生性状植株相比无显著性变化。(2)初步定位:在F2群体中,随机选取50份散生性状植株的DNA等量混合构建散生群体混合池,50份直立性状植株的DNA等量混合构建直立群体混合池。散生群体混合池和直立群体混合池分别进行重测序,共获得44.45 Gbp Clean Bases测序数据,Q30达到80%;平均每个样品测序深度为59.35 X。通过两样品池间基因型存在不同的SNP位点,采用欧式距离算法对目标位点关联分析,在第8染色体上出现一个峰,根据关联阈值判定,共得到1个与散生性状相关的侯选区域,总长度为7.84 Mb。利用两混池间基因型存在差异的InDel进行目标位点关联分析,在第8染色体上也出现一个峰。根据关联阈值判定,共得到1个与散生性状相关的侯选区域,总长度为7.79 Mb。对SNP和InDel相关联的候选区域取交集,共得到1个与散生性状相关的侯选区域,总长度为7.78 Mb。因此,初步将目的基因定位在8号染色体7.78 Mb的区间内。(3)精细定位:在8号染色体关联区域内开发散生性状植株与直立性状植株之间具有多态性SSR、InDel分子标记。利用纯合的散生性状植株自交群体和纯合的直立性状植株自交群体,采用SSR、In Del标记结合BSA-RCA分析的方法,把水稻散生基因LAZY3定位在分子标记XS51与XS52之间的10Kb区间内。