水稻散生基因LAZY3的精细定位

来源 :浙江师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wangxiaofengkobe
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
水稻作为世界上最主要的粮食作物,其产量提高受到广大的关注。理想株型可以通过提高水稻单产而增加水稻的产量。分蘖角度和分蘖数是水稻株型构成的两个重要要素,分别与水稻的种植密度和有效穗数紧密相关,是提高水稻产量的重要农艺性状。我们在药用野生稻与栽培稻的野栽交可育后代中发现了散生性状的自发突变体。在散生自发突变体自交F2群体中,本实验随机选择散生性状和直立性状植株DNA构建混池进行重测序,对控制表型的相关基因进行初步定位,然后通过隐性分析法(RCA),运用SSR、InDel等分子标记,对散生基因LAZY3进行精细定位。结果如下:(1)突变体表型特征及农艺性状统计分析:直立性状植株分蘖角度接近零度,散生性状植株分蘖角度接近30度;直立性状植株分蘖数较散生性状植株增多(P<0.01);直立性状植株百粒重极显著低于散生性状植株(P<0.01),总粒重极显著高于散生性状植株(P<0.01);直立性状植株穗长与散生性状植株相比无显著性变化。(2)初步定位:在F2群体中,随机选取50份散生性状植株的DNA等量混合构建散生群体混合池,50份直立性状植株的DNA等量混合构建直立群体混合池。散生群体混合池和直立群体混合池分别进行重测序,共获得44.45 Gbp Clean Bases测序数据,Q30达到80%;平均每个样品测序深度为59.35 X。通过两样品池间基因型存在不同的SNP位点,采用欧式距离算法对目标位点关联分析,在第8染色体上出现一个峰,根据关联阈值判定,共得到1个与散生性状相关的侯选区域,总长度为7.84 Mb。利用两混池间基因型存在差异的InDel进行目标位点关联分析,在第8染色体上也出现一个峰。根据关联阈值判定,共得到1个与散生性状相关的侯选区域,总长度为7.79 Mb。对SNP和InDel相关联的候选区域取交集,共得到1个与散生性状相关的侯选区域,总长度为7.78 Mb。因此,初步将目的基因定位在8号染色体7.78 Mb的区间内。(3)精细定位:在8号染色体关联区域内开发散生性状植株与直立性状植株之间具有多态性SSR、InDel分子标记。利用纯合的散生性状植株自交群体和纯合的直立性状植株自交群体,采用SSR、In Del标记结合BSA-RCA分析的方法,把水稻散生基因LAZY3定位在分子标记XS51与XS52之间的10Kb区间内。
其他文献
进入21世纪,传统能源极度贫乏的现象日益突出,绿色高效的能量存储和转换设备得到了人们的青睐。其中,超级电容器(SCs)凭借高能量密度、长循环寿命和环境友好等优点脱颖而出。
随着我国现代市场经济的不断发展,企业财务管理的目标已指向企业价值最大化。而国家的各项法律、法规正逐渐优化完善,促使企业由原来的粗放式管理、只注重企业规模方面,开始
随着我国铜产量的逐年增加,堆积的铜渣也逐渐增多,铜渣资源化利用的任务显得更加艰巨。铜渣粉基胶凝材料是由铜渣粉与水泥等原材料配制而成的复合胶凝材料,利用铜渣粉与水泥
锂离子电池具有能量密度高、循环寿命长、记忆效应小、污染小等优点,被认为是未来存储电能的最有效途径。三维电极是当前锂离子电池领域研究的热点,与传统电极相比,它能为体
磷是植物生长所需的必要元素,参与了生物体内各种重要生命活动。高等植物主要通过根系以无机磷酸盐(Pi:PO43-,HPO42-,H2PO4-)的形式从土壤溶液中获得磷元素。因为土壤中的磷
科技进步推动人类社会不断的发展,为了满足人类生产生活的需求,各种便携式的电子设备、大功率电动机车、高功率的移动设备相继问世。目前,锂离子电池作为能源供应系统难以满
随着国家对环境保护力度加大,住建部《污水排入城市下水道水质标准》要求排入城市管网中废水总磷含量小于8 mg/L,某公司(以下简称NCFC)出厂废水中磷含量约为33mg/L,为了满足
配电网中含有大量单相居民负荷,受生活习惯影响,各个时刻居民负荷功率具有随机波动性,这种随机性将导致配电网三相负荷不对称进而引起三相不平衡问题。随着“屋顶光伏”工程
直接甲醇燃料电池(DMFC)因其绿色环保、燃料易得、操作安全、且具有优异的能量密度和高能量转换效率等优点,在便携式及可移动式设备上有广泛的应用前景。目前,DMFC中最常用的
研究背景:肥胖型哮喘是一种独特的哮喘表型,其症状重,对常规哮喘治疗反应差,病情反复,难以控制,其发病机制尚未完全阐明。研究发现,维生素D除了经典的维持钙磷平衡作用外,还