高密度脂蛋白(high density lipoprotein,HDL)在调节机体内血浆胆固醇水平的动态平衡起到了关键性的作用。血浆中的胆固醇过量的累积会导致动脉粥样硬化。大量的实验研究证实了 ATP 结合盒转运蛋白 A1(ATP-binding cassette transporter A1,ABCA1)介导了血浆HDL生成,将体内过量的胆固醇和各类脂蛋白转化为磷脂从而形成HDL。血浆中高密度脂蛋白水平越高,一些心血管疾病的发生概率就越低。在大量的人类疾病和动物模型的研究中已经证实了提高肝脏ABCA1的活性能够增加血浆高密度脂蛋白的水平。本实验以ABCA1作为候选基因,挖掘ABCA1基因启动子区域的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点,分析其与ABCA1基因表达水平及血浆HDL水平的关系。本实验取高低组HDL样品各30个进行DNA混池测序,将ABCA1启动子全部区域测序,进行高低组之间比较。得到了在HDL高组和低组中等位基因分布模式存在差异的两个SNP位点,分别为c.-608A>G和c.-418T>A。采用等位基因特异性PCR技术对这两个位点进行基因分型,通过对526个四元杂交猪的大群分型验证发现这两个位点是完全连锁的,并且只形成了 G-A和A-T两种单倍型。结果显示,G-A/G-A基因型比A-T/A-T基因型拥有更高的血浆HDL水平。对两组各12个不同基因型个体的ABCA1表达水平分析,结果表明G-A/G-A基因型表达水平显著高于A-T/A-T基因型(p<0.05)。通过双荧光素酶活性报告实验检验两种单倍型启动子的活性,结果表明G-A启动子比A-T启动子具有更高的活性,二者差异显著(P<0.05)。点突变实验显示,c.-418 T>A是引起ABCA1转录活性发生变化的关键位点,碱基T突变为A能够引起ABCA1基因启动子活性升高,并且促进了 ABCA1基因表达水平升高,从而提高了血浆HDL水平。本研究通过鉴定ABCA1基因启动子区与血浆HDL水平相关的功能性变异,进一步丰富了血浆HDL水平变异的遗传学机制和理论,为预防动脉粥样硬化(Atherosclerosis,As)和冠心病的治疗提供了新的思路。