内部控制是企业管理重要的内容和基础,是企业实现战略目标的基本保障。风险导向型的内部控制是对企业内外部环境中存在的风险进行识别并分析其影响,根据结果采取一定的内部控制应对策略来抵御风险。医院内部控制是保证医院各项业务正常开展的必要保证,医疗风险是医院所面对的主要风险之一,根据公立医院所处内、外部环境有效地识别风险、建立风险评估和处理体系、积极主动地化解风险、促进医患关系和谐,已成为提高医院服务质量体系和医院发展潜力的重要内容。本文以风险导向型医院内部控制体系的建立为命题,以S市立医院为研究样本,在详细分析医院面临风险并建立风险体系基础上,对如何建立有针对性的内部控制制度进行了研究。本文的主要内容有两个方面,首先是对涉及内部控制和风险管理的基础理论进行了梳理,分析了我国公立医院内部控制的现状及存在的问题；其次是以S市立医院为例,详细地分析了2005年该院“眼球事件”及其反映出的医院在内部控制方面存在的问题,并对医院的内部控制现状和内外部风险进行分析,探讨建立医院风险体系,从单位层面和业务层面建立内部控制制度。单位层面内部控制主要包括工作组织控制、内部控制关键岗位设置、风险预警机制设置和医院文化医德医风建设四个方面；业务层面内部控制从预算业务、收支业务、采购业务、资产控制、信息沟通和监督评价六个方面,对各方面存在的主要风险进行了分析,并针对这些风险设计了相应的内部控制制度。