表皮生长因子受体基因突变检测方法改进及初步应用评估

来源 :南华大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jhl1989
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目的:我们在现有的检测表皮生长因子受体(EGFR)基因突变的荧光PCR法基础上做了进一步改进,并开发出新的试剂盒,本研究将其与直接测序法和A RMS法进行对比,验证该试剂盒用于临床诊断的敏感性、特异性和准确性。方法:收集2013年6月至2015年8月手术确诊的141例非小细胞肺癌(NSCLC)的FFPE组织标本。采用盲法分别使用直接测序法、ARMS法和新试剂盒检测EGFR突变,比较新试剂盒与其他两种检测方法的差异,结果不一致时采用三种方法分别重复检验一次。结果:三种方法检测成功率均为100%,新试剂盒与直接测序法测得结果完全一致的比率达75.9%(107/141),在直接测序法测得的96例突变阳性中,92例在新试剂盒检测中得到验证(95.8%)。而直接测序法显示突变阴性的45例中,新试剂盒检测发现了23例突变阳性,两种检测方法的结果存在统计学差异(X2=40.745,p<0.05)。以直接测序法为金标准进行比较,新试剂盒检测EGFR突变的敏感性、特异性分别为95.8%、48.9%,阳性预测值、阴性预测值分别为80.0%、84.6%,检测准确度为80.9%。新试剂盒与ARMS检测法比较,测得结果完全一致的比率达84.4%(119/141),两者的一致性比较好(k=0.749,p<0.05)。结论:改进后的试剂盒在技术上较好地控制了检测结果的假阳性和假阴性,该检测方法较直接测序法具有更好的敏感性和准确性,与现有的ARMS法一致性较高。
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