虽然固相凝胶 IPGtrip 的商品化使得双向电泳在分离蛋白质上重复性得到很大提高并且已经成研究蛋白质组的支撑技术之一。但是由于影响分辨率和重复性的诸多因素仍然存在,而在蛋白质组研究中首先要对蛋白质进行高分辨率,高重复的分离,然后才是分析鉴定这些蛋白质,所以掌握和建立适合于研究对象的双向电泳技术成为进行蛋白质组研究的关键问题。而能够一次可分离几千个蛋白质的双向电泳就成为进行蛋白质组研究的首选技术。 作者在国内较早地建立和完善了高分辨率、重复性好及高通量的双向凝胶电泳技术基础上,又发展了多根胶条在一块凝胶上进行双向电泳新方法(Multi-stripon one gel MSOG),该方法进一步的提高了 2-DE 的重复性、分辨率和通量。基于该方法具有特别适合于差异蛋白质组研究的特点,我们用它对人肝癌细胞SMMC7721 及其良性回复突变细胞 CL1 进行了差异蛋白质组学研究,并发现了19 个蛋白质点呈现显著性表达差异;分析鉴定结果表明这些蛋白质都直接或间接的与人肝癌细胞 SMMC7721 的良性回复突变相关。一些蛋白质如 maspin 或组织蛋白酶 D(cathepsin D)将有可能发展为肝癌诊断或治疗的潜在标记分子。 用血清蛋白质组对疾病诊断和疗效的评价是医学上里程碑式的事件。血清蛋白质组学是蛋白质组学研究中最引人注目的领域。本文还把在细胞水平上的研究(蛋白质学)转移到血清蛋白质组学的研究,从而把蛋白质组的研究更为直接与重大疾病和临床医学联系起来。通过长期运动对 Cpefat/fat(由于羧肽酶 E 突变而导致肥胖的)小鼠的血清蛋白质组学的研究,发现在长期运动前后的小鼠,发生了包括不同翻译后修饰形式的触珠蛋白(haptoglobin)及一系列的血管舒缓素(kallikrein)等小鼠血清蛋白表达的变化。这一研究不仅建立了高重复性的血清蛋白质组的 2-DE 技术,还发现一些与肥胖相关的重要蛋白质,对在蛋白质翻译水平上揭示运动与肥胖的关系的分子机制,发现与肥胖等疾病候选的标记分子开辟了新的研究途径。