随机扩增多态性DNA标记与矮脚鸡生长及屠宰性状的相关性研究

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为分析兴义矮脚鸡和矮脚黄鸡两个群体的遗传多样性及寻找与生长性状、屠宰性状相关联的随机扩增多态性DNA(RAPD)标记,本试验从40条随机引物中筛选出多态性强、重复性好的引物20条,对兴义矮脚鸡和矮脚黄鸡两个群体的基因组DNA进行RAPD分析.试验结果表明,兴义矮脚鸡中得到总扩增条带159条,多态率为81.7610%,平均每条引物产生多态性片段6.5条;矮脚黄鸡中得到总扩增条带153条,多态率为82.3529%,平均每条引物产生多态性片段6.3条,体现了RAPD标记是一种多态性较高的DNA标记.两群体间的Neis遗传距离为0.2980;兴义矮脚鸡和矮脚黄鸡条带频率分别为0.5771和0.5954,兴义矮脚鸡和矮脚黄鸡群体内的Neis遗传距离分别为0.2716和0.2458,Shannon遗传多样性指数分别为0.4869和0.4851.以上结果表明,两群体的遗传多样性都较为丰富,且兴义矮脚鸡个体间的遗传差异较矮脚黄鸡的大.在分析RAPD标记与性状间的相关时,没有考虑品系的影响,而是将兴义矮脚鸡与矮脚黄鸡作为一个混合群体考虑,目的是增加样本间的差异及含量.但性状可能与性别相连锁,因此分析时分为公、母两个群体.在公、母鸡群分别通过对3180个标记与性状的组合进行T-检验,分别发现了165个和112个显著的标记与性状组合.通过性状间的相关性和两独立样本间个体表型值的分布规律对这些显著标记与性状的组合进行可信性分析,在公鸡群没有找到可信的标记与生长性状相关联,仅找到12个可信的标记与屠宰性状相关联.其中表现为减效的有:S1405.15对腿肌重,S41.10对腿肌重、屠体重、半净膛重、全净膛重,S1409.3对腿肌重;表现为增效的有:S56.2对腿肌重、屠体重、半净膛重、全净膛重,S18.3、S18.4对腿肌重.
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