农业是农民的主要收入来源,为了从根本上解决农户收入的问题,中央及地方每年都有相应的政策,支持、鼓励农户的生产、销售,发展农户成为农业稳定的供应商。基于此背景,本文考虑了三种不同运作模式的农产品供应链,分析了不同模式对农户融入供应链、利润以及稳定性的影响。考虑合作社的外部性,建立三种不同运作模式的供应链模型,求解发现:对于单渠道供应链中农户间的竞争,直销型农户只有通过提高效率来提高竞争力,而加入合作社的农户可以通过合作社的外部性提高竞争力。而且合作社农户能否融入农产品供应链仅与合作社的负外部性有关,与合作社的规模经济无关。在双渠道农产品供应链中,合作社的外部性会同时影响合作社和个体农户。当合作社的规模经济大于一定界限值时,合作社农户与非合作社农户存在排他性。比较分析不同模式下农户的最大利润,发现加入合作社的农户利润均会随着合作社负外部性的增加而减少,而个体农户的利润则随着负外部性的增加而增加。仅“农户+合作社”型单渠道供应链中农户的利润随着合作社规模经济的增加而增加。双渠道供应链中,合作社农户的利润并非一直与合作社的规模经济正相关,当合作社农户的最优产量与规模经济无关时,合作社农户的利润随着规模经济的增加而减少。同样的合作社农户也并非绝对受益于合作社利润分配比例的增加。仅合作社农户提供农产品,合作社农户的利润才随着利润分配比例的增加而增加。本文进一步考虑双渠道供应链中农户加入(退出)合作社的意愿,基于两两稳定性理论分析了双渠道供应链的稳定性。从供应链的稳定性看来,合作社的规模经济、人数以及合作社的利润分配比例均有一定的范围,在该范围内合作社是稳定的。此外,对于合作社的规模经济大于一定界限值时,两个渠道的农户存在排他的情况,本文提出给合作社的农业补贴以缓解合作社规模经济较大时的排他性,保障两个渠道农户的共存、共同的生产积极性。